RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 PDK4Q16654 411 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CHSY3Q70JA7 882 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 NAXEQ8NCW5 288 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 BBOF1Q8ND07 529 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 FBXL20Q96IG2 436 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ART5Q96L15 291 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 RHOJQ9H4E5 214 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 HRKO00198 91 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TGFB1P01137 390 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 C1QAP02745 245 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 RAF1P04049 648 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 EPORP19235 508 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SERPINB3P29508 390 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TIMP3P35625 211 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CASP2P42575 452 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ARL4CP56559 192 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 POU4F1Q01851 419 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CHIT1Q13231 466 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 FAM13CQ8NE31 585 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TANKQ92844 425 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 UBE2E3Q969T4 207 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 KRT12Q99456 494 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CES2O00748 559 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SH3BGRLO75368 114 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 IL2RAP01589 272 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC166P0CW27 439 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 EPXP11678 715 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SSR2P43308 183 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 PLIN5Q00G26 463 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DUSP8Q13202 625 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SLAMF1Q13291 335 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 E2F2Q14209 437 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 LACC1Q8IV20 430 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 LAS2Q8IYD9 372 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TIMP4Q99727 224 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DOHHQ9BU89 302 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CD274Q9NZQ7 290 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SNX12Q9UMY4 172 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DNHD1Q96M86 4753 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 PCNAP12004 261 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TACR1P25103 407 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 WNT3P56703 355 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ATP6V0D1P61421 351 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 KEAP1Q14145 624 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 OR4D1Q15615 310 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 NTRK2Q16620 822 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TBCELQ5QJ74 424 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM198Q66K66 360 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 MED27Q6P2C8 311 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 BIVMQ86UB2 503 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 GPR180Q86V85 440 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 KIF18BQ86Y91 864 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 PM20D2Q8IYS1 436 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SLC35F6Q8N357 371 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms