RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	TAS2R40	P59535	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ACTR3	P61158	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SPIB	Q01892	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ASPH	Q12797	758 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ABR	Q12979	859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CTBP1	Q13363	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ICAM4	Q14773	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636		Q3ZCU0	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RHBG	Q9H310	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A1W2PN81	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MYO1C	O00159	1063 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SULT1B1	O43704	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MED24	O75448	989 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SPDEF	O95238	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CLDN14	O95500	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GLA	P06280	429 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SBK3	P0C264	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	THRA	P10827	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	IDO1	P14902	403 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MYF6	P23409	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CHRNA7	P36544	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNJ1	P48048	391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LIMK2	P53671	638 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CDH15	P55291	814 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PEX3	P56589	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	WNT3	P56703	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	OR1D5	P58170	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PFN3	P60673	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RAP2B	P61225	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms