RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 PPIL6Q8IXY8 311 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 ZNF595Q8IYB9 648 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 PM20D2Q8IYS1 436 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 TRPV3Q8NET8 790 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 OR5L2Q8NGL0 311 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 OR14A16Q8NHC5 309 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 ZPLD1Q8TCW7 415 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 SLC5A11Q8WWX8 675 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 ATL1Q8WXF7 558 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 NTNG2Q96CW9 530 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 MS4A6EQ96DS6 147 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 GNRHR2Q96P88 292 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 NAT9Q9BTE0 207 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 CNIH4Q9P003 139 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 JRKLQ9Y4A0 524 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 IKBKGQ9Y6K9 419 aa10.21□□□□□ -0.77
RNF4-218ENST00000513284 MED12LQ86YW9 2145 aa10.21□□□□□ -0.78
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RNF4-218ENST00000513284 SNPHO15079 494 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 ERN1O75460 977 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 TRAPPC6AO75865 159 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 IGKV3-11P04433 115 aa10.2□□□□□ -0.78
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RNF4-218ENST00000513284 TNNI3P19429 210 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 CRYGSP22914 178 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 GDF1P27539 372 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 NAGLUP54802 743 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 LIM2P55344 173 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 AP1S2P56377 157 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 EIPR1Q53HC9 387 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 ANKRD22Q5VYY1 191 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 BICRALQ6AI39 1079 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 NXPE4Q6UWF7 544 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP10.2□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 69.6
RNF4-218ENST00000513284 MEIOBQ8N635 442 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 NUBPLQ8TB37 319 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 TSNARE1Q96NA8 513 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 TUBA1CQ9BQE3 449 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 G6PC3Q9BUM1 346 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 REG4Q9BYZ8 158 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 YAE1D1Q9NRH1 226 aa10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 ANKRD33BA6NCL7 494 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 CD5LO43866 347 aa10.19□□□□□ -0.78
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RNF4-218ENST00000513284 TNFSF13O75888 250 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 FBXO45P0C2W1 286 aa10.19□□□□□ -0.78
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RNF4-218ENST00000513284 FNTAP49354 379 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 PGGT1BP53609 377 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 IL2P60568 153 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 ID2Q02363 134 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.782e-8■■□□□ 11.9
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RNF4-218ENST00000513284 CYP1B1Q16678 543 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 SPANXN3Q5MJ09 141 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 PAQR3Q6TCH7 311 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa10.19□□□□□ -0.78
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RNF4-218ENST00000513284 NAT8LQ8N9F0 302 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
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RNF4-218ENST00000513284 SFXN3Q9BWM7 321 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 ARL15Q9NXU5 204 aa10.19□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 IKZF3Q9UKT9 509 aa10.19□□□□□ -0.78
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RNF4-218ENST00000513284 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 PLAUP00749 431 aa10.18□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 CPN1P15169 458 aa10.18□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 SAT1P21673 171 aa10.18□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 CPA2P48052 419 aa10.18□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 PCYT1AP49585 367 aa10.18□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 ATP5J2P56134 94 aa10.18□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 CRYMQ14894 314 aa10.18□□□□□ -0.78
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