RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	DYTN	A2CJ06	578 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PGRMC2	O15173	223 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NR2F6	P10588	404 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	HSD3B1	P14060	373 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	HSD3B2	P26439	372 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TNFSF10	P50591	281 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAA20	P61599	178 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	HMGCS1	Q01581	520 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SERTAD2	Q14140	314 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TERF2	Q15554	542 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MEP1A	Q16819	746 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	DOK4	Q8TEW6	326 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TANK	Q92844	425 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	APIP	Q96GX9	242 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDZD2	O15018	2839 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	C17orf105	B2RV13	164 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TNNI3	P19429	210 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLCN2	P51788	898 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAS2R50	P59544	299 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	BTK	Q06187	659 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TLR1	Q15399	786 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MMP21	Q8N119	569 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC5A8	Q8N695	610 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	VMP1	Q96GC9	406 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNF32	Q9H0A6	362 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CENPH	Q9H3R5	247 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FREM3	P0C091	2139 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MED13L	Q71F56	2210 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SERTM1	A2A2V5	107 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR5H15	A6NDH6	313 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GABRR3	A8MPY1	467 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GPR75	O95800	540 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHRNG	P07510	517 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CD96	P40200	585 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ETV4	P43268	484 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	STT3A	P46977	705 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAPK12	P53778	367 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MLF1	P58340	268 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TUBA3C	Q13748	450 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MORN4	Q8NDC4	146 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	DGAT2	Q96PD7	388 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	14.74	□□□□□ -0.05	6e-7	■■■□□ 17.6
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR41	Q9HAD4	459 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SENP1	Q9P0U3	644 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAP10	Q9P2G4	905 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC151	A5D8V7	595 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325		H3BQF6	201 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	HRK	O00198	91 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERLIN1	O75477	346 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	BPGM	P07738	259 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARRB2	P32121	409 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	LGI4	Q8N135	537 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF721	Q8TF20	911 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05

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