RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 RUNX1T1Q06455 604 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 CBR4Q8N4T8 237 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 FRMD1Q8N878 549 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 CDRT4Q8N9R6 151 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 OR5K1Q8NHB7 308 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 MS4A4EQ96PG1 132 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM4Q9C037 500 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 MYL12BO14950 172 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 MAN1A2O60476 641 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 GPR75O95800 540 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 C9P02748 559 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 ST3GAL3Q11203 375 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 FGL2Q14314 439 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 GPR141Q7Z602 305 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 ACTRT3Q9BYD9 372 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 AGAP14A8MT82 685 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 FLRT2O43155 660 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 STX11O75558 287 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 THRBP10828 461 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 CCNA2P20248 432 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 OTX2P32243 289 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 EPHA4P54764 986 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 RAB38P57729 211 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 LPCAT4Q643R3 524 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZSR9 355 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF550Q7Z398 422 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 RNF175Q8N4F7 328 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 OR2T29Q8NH02 315 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 IFI44Q8TCB0 444 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 STON2Q8WXE9 905 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 OR6C1Q96RD1 312 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 PCDHGA12O60330 932 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 EPYCQ99645 322 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 CLMPQ9H6B4 373 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 EGLN2Q96KS0 407 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 EBF2Q9HAK2 575 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.84□□□□□ -1.15
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