RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484046.1

TM4SF1-AS1-201, TM4SF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TM4SF1-AS1, Length 488 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CLCN2P51788 898 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KRT85P78386 507 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KIF5AQ12840 1032 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RCAN2Q14206 197 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NDUFA9Q16795 377 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CNTD1Q8N815 330 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZDHHC22Q8N966 263 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HIPK4Q8NE63 616 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 B3GNT7Q8NFL0 401 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 OR2A1Q8NGT9 310 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DCUN1D1Q96GG9 259 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SGCZQ96LD1 299 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TSGA13Q96PP4 275 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 OR1F2PQ96R84 312 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RASL10BQ96S79 203 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLC39A3Q9BRY0 314 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BTBD2Q9BX70 525 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRABDQ9H4I3 376 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 VPS37BQ9H9H4 285 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ADAP2Q9NPF8 381 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ESM1Q9NQ30 184 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NTMQ9P121 344 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CLCF1Q9UBD9 225 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PCSK1NQ9UHG2 260 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FBXW2Q9UKT8 454 aa4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BUD23O43709 281 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MFSD11O43934 449 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NDST3O95803 873 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PEPDP12955 493 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CYP4B1P13584 511 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF23P17027 643 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IL10P22301 178 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CCNCP24863 283 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PON1P27169 355 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NR4A2P43354 598 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GPR143P51810 404 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLURP1P55000 103 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 STX17P56962 302 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LOXL3P58215 753 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 UBA52P62987 128 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NAA25Q14CX7 972 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DPYSL2Q16555 572 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 VWA1Q6PCB0 445 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 POLNQ7Z5Q5 900 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MRAPQ8TCY5 172 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MCOLN3Q8TDD5 553 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HTRA1Q92743 480 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C3orf49Q96BT1 292 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NUDT11Q96G61 164 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DOCK7Q96N67 2140 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GSDMAQ96QA5 445 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 COPS8Q99627 209 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPATA25Q9BR10 227 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DPH7Q9BTV6 452 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NTMT1Q9BV86 223 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CACNG6Q9BXT2 260 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BRINP2Q9C0B6 783 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 OR10A5Q9H207 317 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CADP27708 2225 aa4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 A0A1W2PPV9 198 aa4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SGK494L7N484 410 aa4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 M0QZ24 198 aa4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NDUFS8O00217 210 aa4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CLOCKO15516 846 aa4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRIM13O60858 407 aa4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RDH16O75452 317 aa4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SRP72O76094 671 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CGAP01215 116 aa4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CALB1P05937 261 aa4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HPNP05981 417 aa4.88□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CRHP06850 196 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms