RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479894.1

HDLBP-238, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 840 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-238	ENST00000479894	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
HDLBP-238	ENST00000479894	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDLBP-238	ENST00000479894	MMP25	Q9NPA2	562 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDLBP-238	ENST00000479894	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDLBP-238	ENST00000479894	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDLBP-238	ENST00000479894	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDLBP-238	ENST00000479894	FFAR3	O14843	346 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	GPR42	O15529	346 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	SLC25A12	O75746	678 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	RAF1	P04049	648 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	CREB1	P16220	341 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	PWP1	Q13610	501 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	E2F2	Q14209	437 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	PCLAF	Q15004	111 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ATG16L1	Q676U5	607 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	MED27	Q6P2C8	311 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	SLC5A8	Q8N695	610 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ESAM	Q96AP7	390 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	TMEM237	Q96Q45	408 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ZNF382	Q96SR6	550 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	CENPK	Q9BS16	269 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	SNX6	Q9UNH7	406 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	TMEM114	B3SHH9	223 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894		H0YGG7	62 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	OR1F1	O43749	312 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	PRMT3	O60678	531 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	CRCP	O75575	148 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	KRT6A	P02538	564 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	KRT6B	P04259	564 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ALDH3A1	P30838	453 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	KRT6C	P48668	564 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	DLX5	P56178	289 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	NUP107	P57740	925 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	REEP5	Q00765	189 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	RGS1	Q08116	209 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	TGM3	Q08188	693 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	DOC2A	Q14183	400 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	NDUFA9	Q16795	377 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	UNC50	Q53HI1	259 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	TTMP	Q5BVD1	217 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ARSK	Q6UWY0	536 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	CDC20B	Q86Y33	519 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894		H0YIV9	168 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	HAT1	O14929	419 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	FOXS1	O43638	330 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ESRRB	O95718	433 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	CHEK2	O96017	543 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	SERPINE1	P05121	402 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	PIK3CB	P42338	1070 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	SCTR	P47872	440 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	TAS2R50	P59544	299 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	PMPCA	Q10713	525 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	IFT88	Q13099	833 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	FAM53B	Q14153	422 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDLBP-238	ENST00000479894	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		14.5	□□□□□ -0.09

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms