RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 BUD23O43709 281 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 HSF2BPO75031 334 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GAGE7O76087 117 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TFAP2AP05549 437 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CELA2AP08217 269 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GAGE12FP0CL80 117 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GAGE12GP0CL81 117 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GAGE12IP0CL82 117 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PRF1P14222 555 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 ITGA2P17301 1181 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CKMT2P17540 419 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SSTR1P30872 391 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 AKT2P31751 481 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 DUTP33316 252 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 MDH1P40925 334 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 RFX2P48378 723 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SNAP25P60880 206 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC34A1Q06495 639 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC20A2Q08357 652 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GAGE1Q13065 139 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GAGE4Q13068 117 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 XKR9Q5GH70 373 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP4A22Q5TCH4 519 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 LYSMD4Q5XG99 296 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SHC4Q6S5L8 630 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 KDELC1Q6UW63 502 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC18BQ6UXF7 455 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GFRALQ6UXV0 394 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 MACC1Q6ZN28 852 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 NUDT13Q86X67 352 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC39A11Q8N1S5 342 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC18CQ8NCF0 446 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 C16orf52Q8NHV5 167 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC107Q8WV48 283 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 VOPP1Q96AW1 172 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CFAP36Q96G28 342 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SCMH1Q96GD3 660 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM213AQ9BRX8 229 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 FTHL17Q9BXU8 183 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 NAPBQ9H115 298 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM245Q9H330 911 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PELI2Q9HAT8 420 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 DONSONQ9NYP3 566 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PKD2L2Q9NZM6 624 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 FZD10Q9ULW2 581 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE4BO95155 1302 aa5.13□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM129A0AVI4 362 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 MAGEB2O15479 319 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNHIT1O43257 154 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SERPINI2O75830 405 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT5P13647 590 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 NR1D1P20393 614 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CCND2P30279 289 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 THOP1P52888 689 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CACNG1Q06432 222 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 IL10RBQ08334 325 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 ELP6Q0PNE2 266 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 HSDL1Q3SXM5 330 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 RAET1GQ6H3X3 334 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 OR7E24Q6IFN5 339 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 B3GLCTQ6Y288 498 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 Q6ZS52 159 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 ASB18Q6ZVZ8 466 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 AMZ2Q86W34 360 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM219Q86XT9 240 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 LGI2Q8N0V4 545 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PPFIBP2Q8ND30 876 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXO30Q8TB52 745 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB7BQ96AH8 199 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PGM2Q96G03 612 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 EGLN1Q9GZT9 426 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CSTL1Q9H114 145 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 ACTL8Q9H568 366 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PIGVQ9NUD9 493 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 MYH6P13533 1939 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 FRMPD4Q14CM0 1322 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.12□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A0G2JNG1 304 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 C17orf105B2RV13 164 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PSMD3O43242 534 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms