RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 OR8D2Q9GZM6 311 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 WDR41Q9HAD4 459 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ANKRD10Q9NXR5 420 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SENP1Q9P0U3 644 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 MAP10Q9P2G4 905 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ARHGAP10A1A4S6 786 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SERTM1A2A2V5 107 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CCDC151A5D8V7 595 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TMEM200CA6NKL6 621 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TCP11X1B4DZS4 312 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 GPR75O95800 540 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CD96P40200 585 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ETV4P43268 484 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 INAQ16352 499 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SPRED3Q2MJR0 410 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CEP85LQ5SZL2 805 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SCIMPQ6UWF3 145 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ATCAYQ86WG3 371 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 MMP21Q8N119 569 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 GALNT11Q8NCW6 608 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ZNF721Q8TF20 911 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CHTF18Q8WVB6 975 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 APIPQ96GX9 242 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 DGAT2Q96PD7 388 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TAAR6Q96RI8 345 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CLMPQ9H6B4 373 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 NMRK1Q9NWW6 199 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ABI3Q9P2A4 366 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 MCM8Q9UJA3 840 aa13.1□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 PKDREJQ9NTG1 2253 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 HRKO00198 91 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 PGRMC2O15173 223 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 PCDH7O60245 1069 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 PRAMEF2O60811 474 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ITGA10O75578 1167 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 NEURL1O76050 574 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 IGKV3-11P04433 115 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CHRNGP07510 517 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 COX7A2P14406 83 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 PIK3R1P27986 724 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SERPINB3P29508 390 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 KCNC4Q03721 635 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ACSM2AQ08AH3 577 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 BIKQ13323 160 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 OR1C1Q15619 314 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SPIN4Q56A73 249 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ZNF766Q5HY98 468 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ACSM2BQ68CK6 577 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CLEC6AQ6EIG7 209 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ZNF227Q86WZ6 799 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 C7orf57Q8NEG2 295 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 GRHL3Q8TE85 626 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ZBTB9Q96C00 473 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TM4SF18Q96CE8 201 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SCMH1Q96GD3 660 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 FBXL20Q96IG2 436 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TRMOQ9BU70 441 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 HES7Q9BYE0 225 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 C1orf226A1L170 272 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CDK2AP1O14519 115 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 FCHO1O14526 889 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NPHS1O60500 1241 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 VPS4BO75351 444 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 UROSP10746 265 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 TNNI3P19429 210 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 GNLYP22749 145 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ARRB2P32121 409 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 HK2P52789 917 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ERVK-8P63133 956 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 RNF4P78317 190 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ASPHQ12797 758 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 KANK2Q63ZY3 851 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SPINK14Q6IE38 97 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SLC48A1Q6P1K1 146 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 GALNT18Q6P9A2 607 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 FAM180AQ6UWF9 173 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 HSDL2Q6YN16 418 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 TRIM46Q7Z4K8 759 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 EXOC3L1Q86VI1 746 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SUN3Q8TAQ9 357 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms