RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	MSH3	P20585	1137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MUT	P22033	750 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CCR10	P46092	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MMP15	P51511	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MFAP3	P55082	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	RBP5	P82980	135 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MYL7	Q01449	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ALCAM	Q13740	583 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ENPP2	Q13822	863 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	STARD5	Q9NSY2	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	AKAP9	Q99996	3911 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080		A6NL46	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PFKFB2	O60825	505 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	HUS1	O60921	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SEMA4F	O95754	770 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GIMD1	P0DJR0	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CPT2	P23786	658 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CD27	P26842	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	NMBR	P28336	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SUOX	P51687	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TGIF1	Q15583	401 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	STPG4	Q8N801	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MCU	Q8NE86	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ASB7	Q9H672	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080		U3KQA8	63 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PDZD2	O15018	2839 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	LAD1	O00515	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	NDUFS4	O43181	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	NR3C1	P04150	777 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MMP9	P14780	707 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CKMT2	P17540	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ACP1	P24666	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	OXTR	P30559	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	METAP1	P53582	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	UCN	P55089	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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