RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 OR5D16Q8NGK9 328 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 COX14Q96I36 57 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 QRFPRQ96P65 431 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PPM1DO15297 605 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 NDUFS4O43181 175 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PDE9AO76083 593 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 NFATC1O95644 943 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 H1F0P07305 194 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CKMT1AP12532 417 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 GPC1P35052 558 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 UGT2B15P54855 530 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CDK3Q00526 305 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CAMK1Q14012 370 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SYPL1Q16563 259 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TMC5Q6UXY8 1006 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 OLIG3Q7RTU3 272 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 HMGN2P46Q86SG4 172 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 LACC1Q8IV20 430 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 RGMAQ96B86 450 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ZNF354BQ96LW1 612 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ZNF607Q96SK3 696 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TMEM245Q9H330 911 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TRPC4Q9UBN4 977 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 REV1Q9UBZ9 1251 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 KLK4Q9Y5K2 254 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 NUMA1Q14980 2115 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CCRL2O00421 344 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ARHGAP33O14559 1287 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 AQP9O43315 295 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PCDH8O95206 1070 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 DLGAP3O95886 979 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SLC35G4P0C7Q5 338 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ALOX12P18054 663 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PTGER1P34995 402 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SOX6P35712 828 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 OPRD1P41143 372 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 IL12RB1P42701 662 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 XKP51811 444 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 REEP5Q00765 189 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 DOC2BQ14184 412 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ARHGAP19Q14CB8 494 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 GAB4Q2WGN9 574 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 FAM78AQ5JUQ0 283 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 METRNLQ641Q3 311 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ITPKCQ96DU7 683 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 WASH6PQ9NQA3 447 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 QPCTLQ9NXS2 382 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 OR1A2Q9Y585 309 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 DSPPQ9NZW4 1301 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 GLOD5A6NK44 160 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 LATO43561 262 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ERGP11308 486 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 GJA8P48165 433 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 KCNJ5P48544 419 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CASP12Q6UXS9 341 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SLC34A3Q8N130 599 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 NATD1Q8N6N6 113 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 FERD3LQ96RJ6 166 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 KCNS3Q9BQ31 491 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 C17orf62Q9BQA9 187 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 KLHL25Q9H0H3 589 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 OR51I1Q9H343 314 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SERHL2Q9H4I8 314 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 XKR8Q9H6D3 395 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 MGAT4BQ9UQ53 548 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 A0A1W2PPV9 198 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ISPDA4D126 451 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 FAAHO00519 579 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 NR2F1P10589 423 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 DDX5P17844 614 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TNNI3P19429 210 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PRKAG1P54619 331 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ILKQ13418 452 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms