RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR155Q7Z3F1 870 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SYT14Q8NB59 555 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 COQ10AQ96MF6 247 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 HS6ST2Q96MM7 605 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC29A3Q9BZD2 475 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN5O00501 218 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 FFAR3O14843 346 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 GPR42O15529 346 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 IRAK2O43187 625 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 HRO43593 1189 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNB2O95067 398 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DQB1P01920 261 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 DNASE1P24855 282 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CARD18P57730 90 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 MAXP61244 160 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 ABHD18Q0P651 414 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 LTB4RQ15722 352 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SGO1Q5FBB7 561 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 BICRALQ6AI39 1079 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM69Q86WT6 500 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR150Q8NGU9 434 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 COPS5Q92905 334 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 PDXPQ96GD0 296 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 EMC7Q9NPA0 242 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 COPZ2Q9P299 210 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 GLS2Q9UI32 602 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA2Q9UM82 520 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 TLR5O60602 858 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX10O60683 326 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 SLC26A5P58743 744 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 TCEA2Q15560 299 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM107Q6UX40 140 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR10G2Q8NGC3 310 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 YIPF5Q969M3 257 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 NXPE2Q96DL1 559 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 KRBOX1C9JBD0 128 aa8□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 YKT6O15498 198 aa8□□□□□ -1.13
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RABGEF1-203ENST00000439720 ITGB7P26010 798 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CCR1P32246 355 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 KDELR2P33947 212 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 PNPLA4P41247 253 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 PCP4P48539 62 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 HK3P52790 923 aa8□□□□□ -1.13
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