RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ULK4Q96C45 1275 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 C7orf34Q96L11 122 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 KCNK12Q9HB15 430 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 NUDT4Q9NZJ9 180 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 STUB1Q9UNE7 303 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SH3D21A4FU49 640 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 PRKAR1AP10644 381 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CDKN2CP42773 168 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 HMGCS1Q01581 520 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 GRK1Q15835 563 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 GPAT4Q86UL3 456 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD46Q86W74 232 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF366Q8N895 744 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 OR6K2Q8NGY2 324 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 UPRTQ96BW1 309 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 BRD9Q9H8M2 597 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 IPPKQ9H8X2 491 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 NLKQ9UBE8 527 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ATPIF1Q9UII2 106 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 HCN2Q9UL51 889 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 POFUT2Q9Y2G5 429 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 COL6A3P12111 3177 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 HYKKA2RU49 373 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 FABP7O15540 132 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 NDUFS3O75489 264 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 RAF1P04049 648 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 MAN2A2P49641 1150 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 POU4F3Q15319 338 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 DDI2Q5TDH0 399 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 GHDCQ8N2G8 530 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SLC37A3Q8NCC5 494 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 LINGO1Q96FE5 620 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CIPCQ9C0C6 399 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 LRTM1Q9HBL6 345 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ELOVL2Q9NXB9 296 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ING4Q9UNL4 249 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 KCNK5O95279 499 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 TPOP07202 933 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SSTR4P31391 388 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 GKP32189 559 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SOX3P41225 446 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CSNK1DP48730 415 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 VASPP50552 380 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 TRIQKQ629K1 86 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ADGRG3Q86Y34 549 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SLC44A3Q8N4M1 653 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SLC5A8Q8N695 610 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CLDN22Q8N7P3 220 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 OR2AP1Q8NGE2 309 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 GALNT9Q9HCQ5 603 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SH3BP4Q9P0V3 963 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 RIMKLBQ9ULI2 386 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SSR3Q9UNL2 185 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CDRT1O95170 752 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 IL1AP01583 271 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 BCKDHAP12694 445 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ANXA8P13928 327 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ABATP80404 500 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 KLHL12Q53G59 568 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CLLU1Q5K131 121 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 TNFRSF11BO00300 401 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 RFXANKO14593 260 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 LYRM1O43325 122 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 DSTNP60981 165 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 TFF2Q03403 129 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 MXD1Q05195 221 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 COL28A1Q2UY09 1125 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 GPR139Q6DWJ6 353 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 Q6ZVU0 165 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM46Q7Z4K8 759 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 OR10G2Q8NGC3 310 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 GIMAP1Q8WWP7 306 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 TPD52L3Q96J77 140 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 MTG2Q9H4K7 406 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PRDM6Q9NQX0 595 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM184CQ9NVA4 438 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 ATP6V1HQ9UI12 483 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.4 ms