RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428963.6

CENPN-204, Transcript of centromere protein N, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CENPN, Length 971 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPN-204ENST00000428963 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.81□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.81□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 LDAHQ9H6V9 325 aa6.81□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 PARVBQ9HBI1 364 aa6.81□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 PROK2Q9HC23 129 aa6.81□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 MYOTQ9UBF9 498 aa6.81□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.81□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.81□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 COL6A5A8TX70 2615 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 SUSD5O60279 629 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 WDR1O75083 606 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 LRATO95237 230 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 TPSB2P20231 275 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 GABRB3P28472 473 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 GRK3P35626 688 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 ASCL1P50553 236 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 ZNF136P52737 540 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 CDKN2DP55273 166 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 DCAF7P61962 342 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 REEP5Q00765 189 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 TPSAB1Q15661 275 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 WLSQ5T9L3 541 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 ABHD13Q7L211 337 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 FAM47BQ8NA70 645 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 SARAFQ96BY9 339 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 QRFPRQ96P65 431 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.8□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 FREM3P0C091 2139 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 CLCA1A8K7I4 914 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 INAFM1C9JVW0 142 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 H7C1Q1 480 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 PFDN6O15212 129 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 NRDCO43847 1150 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 HCN1O60741 890 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 ETHE1O95571 254 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 GUCA1CO95843 209 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 HRGP04196 525 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 C8GP07360 202 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 AHRP35869 848 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 TRPC1P48995 793 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 VPS41P49754 854 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 CCZ1BP86790 482 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 RGS1Q08116 209 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 BMPR2Q13873 1038 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 CSHL1Q14406 222 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 TERF2Q15554 542 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 DUPD1Q68J44 220 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 CASC4Q6P4E1 433 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 HSDL2Q6YN16 418 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 RTL4Q6ZR62 310 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 GK5Q6ZS86 529 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 TMEM139Q8IV31 216 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 DOK4Q8TEW6 326 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 LINGO1Q96FE5 620 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 CCDC77Q9BR77 488 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 DESI2Q9BSY9 194 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 HAUS8Q9BT25 410 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 EXO5Q9H790 373 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.79□□□□□ -1.32
CENPN-204ENST00000428963 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms