RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 GYG2O15488 501 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 FGF17O60258 216 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 TNFSF15O95150 251 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 IFI6P09912 130 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 GABREP78334 506 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 PLIN5Q00G26 463 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 ANKRD46Q86W74 232 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 ESX1Q8N693 406 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM52Q8NDY8 209 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 STT3BQ8TCJ2 826 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF681Q96N22 645 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 AMDHD1Q96NU7 426 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 SH3GL1Q99961 368 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 SERHLQ9NQF3 203 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC22A11Q9NSA0 550 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 MAP10Q9P2G4 905 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 LDB3O75112 727 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 C6orf47O95873 294 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC35E2P0CK97 266 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 CLECL1Q8IZS7 167 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 GALNT6Q8NCL4 622 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 PSMA8Q8TAA3 256 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 UCN3Q969E3 161 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 MOAP1Q96BY2 351 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 LRRC58Q96CX6 371 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 BTBD10Q9BSF8 475 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 LRMDAQ9H2I8 198 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 GLIPR2Q9H4G4 154 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 CTSFQ9UBX1 484 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 PADI1Q9ULC6 663 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 AP3M1Q9Y2T2 418 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM149AA5PLN7 773 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 OR10H2O60403 315 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 ATP1B1P05026 303 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 PPIBP23284 216 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 GALNSP34059 522 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 GPC1P35052 558 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 FEN1P39748 380 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 NCALDP61601 193 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 CPZQ66K79 652 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 PHF12Q96QT6 1004 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 CGREF1Q99674 301 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 NRSN2Q9GZP1 204 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 TAS2R1Q9NYW7 299 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 KIF26BQ2KJY2 2108 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 PCDH17O14917 1159 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 C8orf89P0DMQ9 161 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 HBA1P69905 142 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 HSPB3Q12988 150 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 NKG7Q16617 165 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 VWA2Q5GFL6 755 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 MLIPQ5VWP3 458 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 BHLHB9Q6PI77 547 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 DLEU7Q6UYE1 221 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM64Q6YI46 380 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 RINLQ6ZS11 566 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 CCDC116Q8IYX3 515 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 ARHGAP24Q8N264 748 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 PLPP5Q8NEB5 264 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 OR8J3Q8NGG0 315 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 SUN3Q8TAQ9 357 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 PTCHD1Q96NR3 888 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC46A1Q96NT5 459 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 DGAT2Q96PD7 388 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 SPRY4Q9C004 299 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 CHST8Q9H2A9 424 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 SPAG4Q9NPE6 437 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 CORO2BQ9UQ03 480 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 NUP210LQ5VU65 1888 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 CEP250Q9BV73 2442 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 DCDC2BA2VCK2 349 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 PMS2P1A4D2B8 440 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 STMND1H3BQB6 276 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 DYRK3O43781 588 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 UQCRC2P22695 453 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-202ENST00000397396 CPOXP36551 454 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms