RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 GUCY1B2O75343 617 aa20.49■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 CRCPO75575 148 aa20.49■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZFAND5O76080 213 aa20.49■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGKV3-11P04433 115 aa20.49■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 COX7A2P14406 83 aa20.49■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARRB2P32121 409 aa20.49■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.49■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.49■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.49■□□□□ 0.87
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IGHV3-20-201ENST00000390606 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 CENPHQ9H3R5 247 aa20.49■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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IGHV3-20-201ENST00000390606 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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IGHV3-20-201ENST00000390606 HRKO00198 91 aa20.48■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 AZIN1O14977 448 aa20.48■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDH7O60245 1069 aa20.48■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRAMEF2O60811 474 aa20.48■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC35E2P0CK97 266 aa20.48■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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IGHV3-20-201ENST00000390606 MPP2Q14168 576 aa20.48■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR1C1Q15619 314 aa20.48■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.48■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC48A1Q6P1K1 146 aa20.48■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR4K14Q8NGD5 310 aa20.48■□□□□ 0.87
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IGHV3-20-201ENST00000390606 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.47■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 PIK3R1P27986 724 aa20.47■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 GALNSP34059 522 aa20.47■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 KANK2Q63ZY3 851 aa20.47■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPINK14Q6IE38 97 aa20.47■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 HSDL2Q6YN16 418 aa20.47■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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IGHV3-20-201ENST00000390606 TUBB1Q9H4B7 451 aa20.47■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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IGHV3-20-201ENST00000390606 NPIPB8E9PQR5 432 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 FCHO1O14526 889 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR10H2O60403 315 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 ITGA10O75578 1167 aa20.46■□□□□ 0.87
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IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF766Q5HY98 468 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 CES4AQ5XG92 561 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 SUN3Q8TAQ9 357 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 GRHL3Q8TE85 626 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 C16orf78Q8WTQ4 265 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 RIT1Q92963 219 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCMH1Q96GD3 660 aa20.46■□□□□ 0.87
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IGHV3-20-201ENST00000390606 ART5Q96L15 291 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAIM2Q9BWQ8 316 aa20.46■□□□□ 0.87
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IGHV3-20-201ENST00000390606 HES7Q9BYE0 225 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRFN1Q9P244 771 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAP10Q9P2G4 905 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYOTQ9UBF9 498 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-20-201ENST00000390606 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa20.45■□□□□ 0.86
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM233B4DJY2 109 aa20.45■□□□□ 0.86
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.45■□□□□ 0.86
IGHV3-20-201ENST00000390606 TM9SF1O15321 606 aa20.45■□□□□ 0.86
IGHV3-20-201ENST00000390606 CLPSP04118 112 aa20.45■□□□□ 0.86
IGHV3-20-201ENST00000390606 IL3P08700 152 aa20.45■□□□□ 0.86
IGHV3-20-201ENST00000390606 CPMP14384 443 aa20.45■□□□□ 0.86
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRPH2P23942 346 aa20.45■□□□□ 0.86
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYB561P49447 251 aa20.45■□□□□ 0.86
IGHV3-20-201ENST00000390606 HLCSP50747 726 aa20.45■□□□□ 0.86
IGHV3-20-201ENST00000390606 HK2P52789 917 aa20.45■□□□□ 0.86
IGHV3-20-201ENST00000390606 ERVK-8P63133 956 aa20.45■□□□□ 0.86
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNC4Q03721 635 aa20.45■□□□□ 0.86
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