RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 PGRMC2O15173 223 aa14.37□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 PDGFAP04085 211 aa14.37□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00032P0C843 101 aa14.37□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC35E2P0CK97 266 aa14.37□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 NR1D1P20393 614 aa14.37□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 GALNSP34059 522 aa14.37□□□□□ -0.11
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PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.37□□□□□ -0.11
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PGGT1B-202ENST00000379615 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
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PGGT1B-202ENST00000379615 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.37□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.37□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.36□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.36□□□□□ -0.11
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PGGT1B-202ENST00000379615 ACER2Q5QJU3 275 aa14.36□□□□□ -0.11
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PGGT1B-202ENST00000379615 APCDD1LQ8NCL9 501 aa14.35□□□□□ -0.11
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.35□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 HAS2Q92819 552 aa14.35□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 RIT1Q92963 219 aa14.35□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 NCLNQ969V3 563 aa14.35□□□□□ -0.11
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PGGT1B-202ENST00000379615 KLHL29Q96CT2 875 aa14.35□□□□□ -0.11
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PGGT1B-202ENST00000379615 MYNNQ9NPC7 610 aa14.35□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.35□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.35□□□□□ -0.11
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PGGT1B-202ENST00000379615 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.34□□□□□ -0.11
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PGGT1B-202ENST00000379615 FCHO1O14526 889 aa14.34□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC28A2O43868 658 aa14.34□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 CASRP41180 1078 aa14.34□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR143P51810 404 aa14.34□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 C2orf80Q0P641 193 aa14.34□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA0040Q15053 153 aa14.34□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.34□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 TTMPQ5BVD1 217 aa14.34□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.34□□□□□ -0.11
PGGT1B-202ENST00000379615 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.34□□□□□ -0.11
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