RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359751.8

EFNA4-201, Transcript of ephrin A4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFNA4, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4-201ENST00000359751 ASIC5Q9NY37 505 aa14.91□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 DPM1O60762 260 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 LDB3O75112 727 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 TGDSO95455 350 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 IL3P08700 152 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ALDH9A1P49189 494 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 CHAF1BQ13112 559 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 GALNTL6Q49A17 601 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 KLHL29Q96CT2 875 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 EBPLQ9BY08 206 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 MGAQ8IWI9 3026 aa14.9□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 C17orf105B2RV13 164 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 TBX19O60806 448 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 ATP1B1P05026 303 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 FAM87AP0C7U9 286 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 CPMP14384 443 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 NTSP30990 170 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 MPIP34949 423 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 HPCAL1P37235 193 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 XKP51811 444 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 EFNA3P52797 238 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 ERVK-8P63133 956 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 EMX2Q04743 252 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 OGFOD2Q6N063 350 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 IGFL3Q6UXB1 125 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 OR2T11Q8NH01 316 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 RIT1Q92963 219 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 FBXL20Q96IG2 436 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 RNF32Q9H0A6 362 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 KCNK13Q9HB14 408 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 CFL2Q9Y281 166 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 LAMA5O15230 3695 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 ITPR1Q14643 2758 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 DYTNA2CJ06 578 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 OR2W5A6NFC9 320 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 OR6C76A6NM76 312 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 FCHO1O14526 889 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 PEX11AO75192 247 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 DNAJB5O75953 348 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 IFI6P09912 130 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 LBPP18428 481 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 PSPHP78330 225 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 C2orf80Q0P641 193 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 MFAP5Q13361 173 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 MEP1AQ16819 746 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 CES4AQ5XG92 561 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 OR7G1Q8NGA0 311 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 ELP5Q8TE02 316 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.88□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.87□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.87□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 GLOD5A6NK44 160 aa14.87□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 A6NL46 340 aa14.87□□□□□ -0.03
EFNA4-201ENST00000359751 PGRMC2O15173 223 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms