RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 SNNO75324 88 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKCGP05129 697 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GM2AP17900 193 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CXCR1P25024 350 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 INAVAQ3KP66 663 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CD300LGQ6UXG3 332 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CEP68Q76N32 757 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NANPQ8TBE9 248 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 VRTNQ9H8Y1 702 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GNG8Q9UK08 70 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF212BA8MTL3 300 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 F5H5P2 479 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 BMP1P13497 986 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SF1Q15637 639 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TPRA1Q86W33 373 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PARGQ86W56 976 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CPA6Q8N4T0 437 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RLIMQ9NVW2 624 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4F21O95013 312 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DECR1Q16698 335 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 C9orf57Q5W0N0 161 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PPTC7Q8NI37 304 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.771e-6■■□□□ 12.4
SH3BP2-201ENST00000356331 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ICKQ9UPZ9 632 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGA5P08648 1049 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MASP1P48740 699 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MTFR2Q6P444 385 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF783Q6ZMS7 281 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM74Q96NL1 305 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HBEGFQ99075 208 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NIPAL2Q9H841 368 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GRHPRQ9UBQ7 328 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 LRP5LA4QPB2 252 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 WNT9AO14904 365 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB3AP20336 220 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF792Q3KQV3 632 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NPAS3Q8IXF0 933 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1191Q96A73 305 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNH6Q9H252 994 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GAREM1Q9H706 876 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP8B1Q9UNU6 501 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CD34P28906 385 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OR12D2P58182 307 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF616Q08AN1 781 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF763Q0D2J5 394 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GFOD2Q3B7J2 385 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 LIPJQ5W064 366 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PIGZQ86VD9 579 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PYCR2Q96C36 320 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RBCK1Q9BYM8 510 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 BEX1Q9HBH7 125 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DHDHQ9UQ10 334 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HDCP19113 662 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CA5AP35218 305 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 POU4F3Q15319 338 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2AG1Q9H205 316 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MMP28Q9H239 520 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CRTAC1Q9NQ79 661 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CA5BQ9Y2D0 317 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RAI2Q9Y5P3 530 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM221A6NGB7 291 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 A8MT66 165 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 A8MVJ9 347 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM150CB9EJG8 249 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CASP3P42574 277 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNC1P48547 511 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CASP9P55211 416 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP1Q07960 439 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 NIPAL4Q0D2K0 466 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 OR5B17Q8NGF7 314 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 HEXBP07686 556 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MFSD13AQ14CX5 517 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 NTRK2Q16620 822 aa10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms