RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259008.6

BRIP1-201, Transcript of BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRIP1, Length 6,048 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1-201ENST00000259008 NR2C1P13056 603 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ICAM2P13598 275 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 HK1P19367 917 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 OR1E2P47887 323 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 PGFP49763 221 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 SSR4P51571 173 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 SERTAD2Q14140 314 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 EVPLQ92817 2033 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 PRODHO43272 600 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 SOX30O94993 753 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 PSMG1O95456 288 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 NPIPA8P0DM63 369 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 CREB1P16220 341 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 SIRPAP78324 504 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 SLC34A1Q06495 639 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 MYBPHQ13203 477 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 LIN52Q52LA3 116 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 A0A1W2PPC4 97 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 FLRT2O43155 660 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 PRLP01236 227 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 SPARCP09486 303 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 CCR7P32248 378 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ZXDBP98169 803 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 MADCAM1Q13477 382 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 SFT2D3Q587I9 215 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 LCTLQ6UWM7 567 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 PGBD5Q8N414 524 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 FANK1Q8TC84 345 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 TCEAL3Q969E4 200 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 CRELD1Q96HD1 420 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 TRIB3Q96RU7 358 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 CD248Q9HCU0 757 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 STMN3Q9NZ72 180 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 MKLN1Q9UL63 735 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 EDIL3O43854 480 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 UGT2B11O75310 529 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ZFAND5O76080 213 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 IL32P24001 234 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 TRAF3Q13114 568 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 MYBPC3Q14896 1274 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 TAZQ16635 292 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 KDELC1Q6UW63 502 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 MCHR1Q99705 422 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 MCUBQ9NWR8 336 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 SH3D21A4FU49 640 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 TMEM202A6NGA9 273 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 CENPXA8MT69 81 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 M0QX08 132 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ABLIM1O14639 778 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 DIRAS1O95057 198 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 PGRP06401 933 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 OPRD1P41143 372 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 TCTN1Q2MV58 587 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.05□□□□□ -1.44
BRIP1-201ENST00000259008 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.8 ms