RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 LEFTY1O75610 366 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 C1orf105O95561 183 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 TSPAN19P0C672 248 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 RPS5P46782 204 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 E2F2Q14209 437 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 FLYWCH1Q4VC44 716 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 LHX8Q68G74 356 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 RAB8BQ92930 207 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM169Q96HH4 297 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 GULP1Q9UBP9 304 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 MALT1Q9UDY8 824 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 DYRK1BQ9Y463 629 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 SLC35F4A4IF30 521 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 ARRDC5A6NEK1 342 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 GPC1P35052 558 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 ARSIQ5FYB1 569 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 SAXO2Q658L1 398 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 VWA5B2Q8N398 1253 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 GPR32P1Q8NGA4 272 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 TIFAQ96CG3 184 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 MTG2Q9H4K7 406 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 MIEF1Q9NQG6 463 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 GPSM3Q9Y4H4 160 aa25.71■■□□□ 1.71
FAM149A-201ENST00000227065 OR6C70A6NIJ9 312 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 ITGB7P26010 798 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 SDC2P34741 201 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 SLC7A9P82251 487 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF284Q2VY69 593 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 YIF1BQ5BJH7 314 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 BRAT1Q6PJG6 821 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 NELL2Q99435 816 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 TAAR2Q9P1P5 351 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 ERVH48-1M5A8F1 160 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 PLA2G10O15496 165 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 ADAP00813 363 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 TM4SF4P48230 202 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 PRLHRP49683 370 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 DCDC1P59894 354 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 ATAT1Q5SQI0 421 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 SLC38A5Q8WUX1 472 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 GLYATL1Q969I3 302 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 FRMD6Q96NE9 622 aa25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 ILKQ13418 452 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 NCF4Q15080 339 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 HORMAD2Q8N7B1 307 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 SORCS1Q8WY21 1168 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 NLNQ9BYT8 704 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 RNF121Q9H920 327 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 CCL26Q9Y258 94 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 C5orf58C9J3I9 102 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 TIMP2P16035 220 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 RPL3P39023 403 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 ETV5P41161 510 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 ETV1P50549 477 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 CHRNEQ04844 493 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 C1DQ13901 141 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 FAM209AQ5JX71 171 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 DCST1Q5T197 706 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 OR2G6Q5TZ20 316 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 MEDAGQ5VYS4 303 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 TCTN3Q6NUS6 607 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 CFAP206Q8IYR0 622 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 RDH10Q8IZV5 341 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 TOR4AQ9NXH8 423 aa25.69■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 PRKYO43930 277 aa25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 GPLD1P80108 840 aa25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 HEPACAMQ14CZ8 416 aa25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 PRR23CQ6ZRP0 262 aa25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 PROKR2Q8NFJ6 384 aa25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 OR4D11Q8NGI4 311 aa25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 EFCAB11Q9BUY7 163 aa25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 SPG21Q9NZD8 308 aa25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 ANKDD1BA6NHY2 528 aa25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 QSOX1O00391 747 aa25.68■■□□□ 1.7
FAM149A-201ENST00000227065 CA8P35219 290 aa25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms