RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076372.4

Sf3b4-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Trim75Q3UWZ0 467 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lin28bQ45KJ6 247 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Chsy3Q5DTK1 884 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 MuskQ61006 868 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Klhl14Q69ZK5 630 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dusp23Q6NT99 150 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lrrc75bQ7TPD7 306 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr128Q7TRJ1 308 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc25a40Q8BGP6 337 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dcaf12l2Q8BGW4 469 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Leng9Q8BTN6 485 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Grip1Q925T6 1127 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Yipf2Q99LP8 312 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Kat8Q9D1P2 458 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn1r52Q9EP79 309 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Il18bpQ9Z0M9 193 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cacna1hO88427 2365 aa14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm43518A0A0G2JGB6 165 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm5861F6VCN9 180 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm10260F6YVP7 152 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 4933402N22RikF7D1B3 190 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 P01629 112 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Epha4Q03137 986 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Klrb1Q0ZUP1 214 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lpcat1Q3TFD2 534 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Atf7ip2Q3UL97 452 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 E2f1Q61501 430 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 MogQ61885 246 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr798Q7TRH8 311 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Kcmf1Q80UY2 381 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Chst14Q80V53 376 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Prr5Q812A5 387 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pex26Q8BGI5 305 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cdk5rap1Q8BTW8 588 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc44a2Q8BY89 706 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gpr22Q8BZL4 432 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Znf451Q8C0P7 1056 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Kctd11Q8K485 232 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rsph14Q9D3W1 341 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn1r40Q9EQ46 310 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fads3Q9JJE7 449 aa14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Igkv6-25A0A140T8N7 115 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn2r105E9Q3A5 860 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm8922F6XVS9 199 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 LipiF6YQT7 476 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Grap2O89100 322 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PpiaP17742 164 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CtskP55097 329 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Arhgap39P59281 1107 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Q3TTL0 348 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Itgb2lQ3UV74 738 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Flot2Q60634 428 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zpbp2Q6X786 326 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr857Q7TRF7 309 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Serinc5Q8BHJ6 461 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gpr157Q8C206 330 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 TbcelQ8C5W3 424 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 BphlQ8R164 291 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 AcmsdQ8R519 336 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zfp709Q8VC29 727 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr582Q8VGV9 319 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pcdhga4Q91XY4 930 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tmem186Q9CR76 216 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1700080O16RikQ9D9G4 284 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Chst11Q9JME2 352 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Hspb3Q9QZ57 154 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Padi4Q9Z183 666 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ascc3E9PZJ8 2198 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1700028J19RikA0A0U1RP08 172 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm595A2AF73 655 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Syndig1A2ANU3 258 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 EXOC1LB9EK06 172 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Herc6F2Z461 1003 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 2610028H24RikG5E8K1 270 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Hax1O35387 280 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Bcl2a1dO55179 172 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 P01667 111 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 FshrP35378 692 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 ArsaP50428 506 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lrpap1P55302 360 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fgf1P61148 155 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fbxo40P62932 710 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 B4galnt2Q09199 510 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mmp25Q3U435 615 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Hspb6Q5EBG6 162 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 RflnaQ7TS73 204 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mup21Q80YX8 181 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Acbd3Q8BMP6 525 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Znf574Q8BY46 900 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Serpina11Q8CIE0 424 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vps4aQ8VEJ9 437 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Acy1Q99JW2 408 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Q9D4G1 230 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Erv3Q9DAX3 200 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 AcoxlQ9DBS4 632 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tcea2Q9QVN7 299 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.9 ms