RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GcshQ91WK5 170 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nt5c1bQ91YE9 573 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lrch4Q921G6 680 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slco1a6Q99J94 670 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plpp3Q99JY8 312 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Actr3Q99JY9 418 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 4930519G04RikQ9CPT7 205 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trappc5Q9CQA1 188 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bex4Q9CWT2 118 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem135Q9CYV5 458 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nkain1Q9D035 207 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mgrn1Q9D074 532 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spc24Q9D083 201 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 S100pbpQ9D5K4 396 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc52a3Q9D6X5 460 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RtcAQ9D7H3 366 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dhx34Q9DBV3 1145 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem8aQ9ESN3 769 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dmap1Q9JI44 468 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 B3galt5Q9JI67 308 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Psmg1Q9JK23 289 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sec61a2Q9JLR1 476 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kifc1Q9QWT9 674 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prss16Q9QXE5 509 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Copg2Q9QXK3 871 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spint2Q9WU03 252 aa5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 FlnaQ8BTM8 2647 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Asxl3Q8C4A5 2259 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DytnA2CI98 653 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam47eD3YWC7 402 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pdia2D3Z6P0 527 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fbxl18E9PYR1 771 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Apold1E9Q0X2 246 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn2r56E9Q4U5 779 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm3755K7N743 167 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr738L7N1X7 311 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm3424L7N298 263 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm8374L7N2A9 172 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam71e2L7N480 754 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm8246M0QWX9 263 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc1a6O35544 561 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fgf10O35565 209 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ChgbP16014 677 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SagP20443 403 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wt1P22561 449 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccnd1P25322 295 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rpl5P47962 297 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mtf1Q07243 675 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AmbpQ07456 349 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Glt6d1Q2NKH9 311 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kcnh6Q32ME0 950 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q3U4G0 281 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mthfd1lQ3V3R1 977 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pla2g4dQ50L43 825 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Heatr9Q5QNV8 569 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Grb10Q60760 621 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Krt32Q62168 407 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ift52Q62559 426 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arl13bQ640N2 427 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atp2a3Q64518 1038 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Azgp1Q64726 307 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ToxQ66JW3 526 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q6GQU0 248 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cxxc4Q6NXI8 198 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zpbp2Q6X786 326 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ssxb5Q6XAS2 159 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ints7Q7TQK1 966 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plekhm1Q7TSI1 1074 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ddhd1Q80YA3 547 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 9130023H24RikQ8BG98 337 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tm9sf4Q8BH24 643 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnd1Q8BLR7 232 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lix1lQ8BQ89 337 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klhl38Q8BSF5 581 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc151Q8BSN3 593 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Uba6Q8C7R4 1053 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atxn7l2Q8C8K6 696 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CntrobQ8CB62 887 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dleu7Q8CHZ8 209 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klhl2Q8JZP3 593 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ugt3a2Q8JZZ0 523 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ift80Q8K057 777 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Btbd6Q8K2J9 488 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Grhl2Q8K5C0 625 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Crb3Q8QZT4 113 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vps37bQ8R0J7 285 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mptx1Q8R1M8 219 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prpsap2Q8R574 369 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spsb4Q8R5B6 273 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cops8Q8VBV7 209 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr448Q8VES9 310 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr700Q8VFM5 316 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1440Q8VFV4 315 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr807Q8VGI9 311 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smap1Q91VZ6 440 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sult5a1Q91X36 291 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pomgnt1Q91X88 660 aa5.07□□□□□ -1.6
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pcdhga4Q91XY4 930 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.5 ms