RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dlgap2Q8BJ42 1059 aa12.27□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krcc1Q99JT5 256 aa12.27□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4931417E11RikQ9CR05 305 aa12.27□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dusp12Q9D0T2 339 aa12.27□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NtsQ9D3P9 169 aa12.27□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp4v2Q9DBW0 525 aa12.27□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GmfgQ9ERL7 142 aa12.27□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pex11bQ9Z210 259 aa12.27□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r86L7N213 316 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NsmafO35242 920 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp30Q3UN04 517 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grhl3Q5FWH3 603 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ostf1Q62422 215 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grm7Q68ED2 915 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zic5Q7TQ40 622 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc41a2Q8BYR8 573 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tm6sf2Q8R1J1 378 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem30aQ8VEK0 364 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Laptm4bQ91XQ6 227 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Brinp1Q920P3 760 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nudt7Q99P30 236 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Med31Q9CXU1 131 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 VapaQ9WV55 249 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc7Q9Z0H0 564 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ate1Q9Z2A5 516 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C4bP01029 1738 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pde4dipQ80YT7 2224 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm11634A0A1B0GSX1 172 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r101E9PZS9 857 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10715J3QP74 227 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnk4O88454 398 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 F2rl3O88634 396 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adrb1P34971 466 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GuloP58710 440 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sox14Q04892 240 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdh7Q8BM92 785 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AgmoQ8BS35 447 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc42ep1Q91W92 409 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Asb6Q91ZU1 418 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Uck2Q99PM9 261 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gnpda2Q9CRC9 276 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rgs20Q9QZB1 239 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xkr6E9Q6C8 638 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arfip1G5E8V9 373 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ackr2O08707 378 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtnd1P03888 318 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Htr7P32304 448 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IduaP48441 634 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdkn2bP55271 130 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il11ra2P70225 432 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fahd2Q3TC72 313 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc36a2Q8BHK3 478 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrps35Q8BJZ4 320 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EndovQ8C9A2 338 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oard1Q8R5F3 152 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Osgin1Q8VC10 478 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 L3hypdhQ9CXA2 354 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Subh2bvQ9D9Z7 123 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stk19Q9JHN8 254 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AgtrapQ9WVK0 161 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm29797A0A140LIA7 188 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grk6O70293 576 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stx4P70452 298 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RptnP97347 1118 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pyroxd2Q3U4I7 581 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bend6Q6PFX2 281 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb26Q8C8S0 451 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhl22Q99JN2 634 aa12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl14Q9CR57 217 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8444F6XS56 118 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab11fip2G3XA57 512 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 OtcP11725 354 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbx5P70326 518 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc30a3P97441 388 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sema4cQ64151 834 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam180aQ8BR21 173 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Leng9Q8BTN6 485 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr22Q8BZL4 432 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf276Q8CE64 614 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r84Q8R284 318 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Med17Q8VCD5 649 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lipt1Q8VCM4 373 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrgprb4Q91ZC0 321 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oosp1Q925U0 202 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fuca1Q99LJ1 452 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem174Q9DCX7 243 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elmod1Q3V1U8 326 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ClpbQ60649 677 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhga7Q6DD96 935 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prr11Q8BHE0 368 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SowahcQ8C0J6 512 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cox10Q8CFY5 443 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Batf3Q9D275 118 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr930Q9EQ99 308 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Obox6G3X9U1 347 aa12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.9 ms