RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	LHX9	Q9NQ69	397 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SEMA7A	O75326	666 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ADORA3	P0DMS8	318 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CHM	P24386	653 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CNR2	P34972	360 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CKAP5	Q14008	2032 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	METRNL	Q641Q3	311 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD4A	Q8N468	514 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PDXP	Q96GD0	296 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	C12orf66	Q96MD2	445 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OR51E2	Q9H255	320 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	HCN2	Q9UL51	889 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ICK	Q9UPZ9	632 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	KCNK6	Q9Y257	313 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN24	A6NM45	220 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	GABRB1	P18505	474 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DRD3	P35462	400 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PRKAG1	P54619	331 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CDC42	P60953	191 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MED22	Q15528	200 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	S100Z	Q8WXG8	99 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	NEURL3	Q96EH8	262 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	COL21A1	Q96P44	957 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PPV9	198 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ANHX	E9PGG2	379 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OR10H3	O60404	316 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ADRA2A	P08913	450 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CDH3	P22223	829 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CBL	P22681	906 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	LIMS1	P48059	325 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R38	P59533	333 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SEC23B	Q15437	767 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SAXO2	Q658L1	398 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SMPDL3A	Q92484	453 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35B4	Q969S0	331 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MYO10	Q9HD67	2058 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152		H3BN98	237 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	HMGN4	O00479	90 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFS4	O43181	175 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SLC28A2	O43868	658 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OR12D1	P0DN82	309 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CXCR2	P25025	360 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	GPC1	P35052	558 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	KCNC4	Q03721	635 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RELA	Q04206	551 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CD300C	Q08708	224 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RPA4	Q13156	261 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SYPL1	Q16563	259 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	COLEC12	Q5KU26	742 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT13	Q86X67	352 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	FCGR1B	Q92637	280 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CHFR	Q96EP1	664 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OR5M11	Q96RB7	305 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MENT	Q9BUN1	341 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RHBG	Q9H310	441 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DSN1	Q9H410	356 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	KCNK12	Q9HB15	430 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PP55	124 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MFN2	O95140	757 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RPN2	P04844	631 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OPRD1	P41143	372 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SSR2	P43308	183 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	HMGA2	P52926	109 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CRISP1	P54107	249 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42

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