RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3R1P27986 724 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 EFNA3P52797 238 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ERVK-8P63133 956 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 EMX2Q04743 252 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 CHIT1Q13231 466 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPRE2Q15555 327 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 INAQ16352 499 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PRTGQ2VWP7 1150 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM198Q66K66 360 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 LCTLQ6UWM7 567 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 KBTBD2Q8IY47 623 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2A1Q8NGT9 310 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPEARQ8WU66 669 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 MIEF2Q96C03 454 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGFRNQ9P2B2 879 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6AP2O75787 350 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 COX4I1P13073 169 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ARG2P78540 354 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ABRAXAS2Q15018 415 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf136Q5SQH8 315 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFAF7Q7L592 441 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2L3Q8NG85 312 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SMPDL3AQ92484 453 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R1Q9NYW7 299 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV17A0A0B4J275 112 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0J9YVX5 310 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF4O60810 478 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINA7P05543 415 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD3B1P14060 373 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 EZRP15311 586 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD3B2P26439 372 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 RIPPLY3P57055 190 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 STX1BP61266 288 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 TBPL1P62380 186 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 LAPTM5Q13571 262 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SIRT6Q8N6T7 355 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS50Q96JG6 964 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ASIC5Q9NY37 505 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 DYRK1BQ9Y463 629 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2A25A4D2G3 310 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 B2RBV5 119 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD65E5RJM6 399 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 LSM1O15116 133 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 F10P00742 488 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 HTR6P50406 440 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 OCA2Q04671 838 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 DOC2AQ14183 400 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 XKR6Q5GH73 641 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 FRG2Q64ET8 278 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 GFRALQ6UXV0 394 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2T11Q8NH01 316 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 LURAP1Q96LR2 239 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 FRG2BQ96QU4 278 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 BRINP2Q9C0B6 783 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ELOVL6Q9H5J4 265 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ABI3Q9P2A4 366 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR45Q9Y5Y3 372 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 DYTNA2CJ06 578 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 FFAR3O14843 346 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR42O15529 346 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 GPX3P22352 226 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 CA7P43166 264 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 STX5Q13190 355 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAL1Q4LDG9 190 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms