RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	LINC01387	J3KSC0	135 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PIR	O00625	290 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	GPR171	O14626	319 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	OR1I1	O60431	355 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	EPO	P01588	193 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	FGF1	P05230	155 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PRPH2	P23942	346 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CDKN2C	P42773	168 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	LIMS1	P48059	325 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	IL10RB	Q08334	325 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	FGL1	Q08830	312 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	TPBG	Q13641	420 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	GRM7	Q14831	915 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	TEAD4	Q15561	434 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	C22orf42	Q6IC83	251 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ASIC4	Q96FT7	647 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	BRD7	Q9NPI1	651 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CCL22	O00626	93 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	NMB	P08949	121 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	BPI	P17213	487 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	LCN1	P31025	176 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	LBX1	P52954	281 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CRISP1	P54107	249 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	OPCML	Q14982	345 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ATF6B	Q99941	703 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ABCG4	Q9H172	646 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	IPPK	Q9H8X2	491 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	WBP1L	Q9NX94	342 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	HCN2	Q9UL51	889 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM50B	Q9Y247	325 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	HPGDS	O60760	199 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ULK1	O75385	1050 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	GPR32	O75388	356 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	BEST1	O76090	585 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SRC	P12931	536 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	BTC	P35070	178 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PCGF2	P35227	344 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	NNMT	P40261	264 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CD86	P42081	329 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	RAB13	P51153	203 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	OCLN	Q16625	522 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CORO6	Q6QEF8	472 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	TEX26	Q8N6G2	289 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	NXPE3	Q969Y0	559 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	HBEGF	Q99075	208 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	RNF39	Q9H2S5	420 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	FN3K	Q9H479	309 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	GAREM1	Q9H706	876 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	RLIM	Q9NVW2	624 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	KLK14	Q9P0G3	267 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ALPK3	Q96L96	1907 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PRMT3	O60678	531 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ENTPD6	O75354	484 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	IGLV3-25	P01717	112 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	IFNA4	P05014	189 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ADRB1	P08588	477 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ENG	P17813	658 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CXCL3	P19876	107 aa		10.22	□□□□□ -0.77

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