RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PYROXD1Q8WU10 500 aa23.01■■□□□ 1.27
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PTPRF-216ENST00000617451 SARAFQ96BY9 339 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 RBBP8Q99708 897 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 CPNE1Q99829 537 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 LDAHQ9H6V9 325 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 TXNDC16Q9P2K2 825 aa23.01■■□□□ 1.27
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PTPRF-216ENST00000617451 FGF17O60258 216 aa23■■□□□ 1.27
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PTPRF-216ENST00000617451 DLX5P56178 289 aa23■■□□□ 1.27
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PTPRF-216ENST00000617451 L3MBTL1Q9Y468 752 aa23■■□□□ 1.27
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PTPRF-216ENST00000617451 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
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PTPRF-216ENST00000617451 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.98■■□□□ 1.27
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PTPRF-216ENST00000617451 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 OR51B5Q9H339 312 aa22.97■■□□□ 1.27
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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PTPRF-216ENST00000617451 ALKBH4Q9NXW9 302 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP22.97■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 DYRK3O43781 588 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 C1QAP02745 245 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 RFPL3SP0C7P2 107 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 GABRA1P14867 456 aa22.96■■□□□ 1.27
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