RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 HOMER3Q9NSC5 361 aa16.63■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 JKAMPQ9P055 326 aa16.63■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa16.63■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 SMPD2O60906 423 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 ETHE1O95571 254 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 CTSSP25774 331 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 GDF1P27539 372 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 OPRM1P35372 400 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 PGGT1BP53609 377 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 MTTPP55157 894 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 SERTAD2Q14140 314 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 TRIM40Q6P9F5 258 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 SBSNQ6UWP8 590 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 LYPD8Q6UX82 237 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 PM20D2Q8IYS1 436 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 RASGEF1CQ8N431 466 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 SMPDL3BQ92485 455 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 BDH2Q9BUT1 245 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 CNIH4Q9P003 139 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.62■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 CES2O00748 559 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 LDB3O75112 727 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 GSTM2P28161 218 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 MAGEA3P43357 314 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 ID2Q02363 134 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 ADPRMQ3LIE5 342 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 CAPN12Q6ZSI9 719 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 C9orf40Q8IXQ3 194 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 SLC15A4Q8N697 577 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 FAM13CQ8NE31 585 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 OR10G3Q8NGC4 313 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 SIGLEC10Q96LC7 697 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 PIP5K1AQ99755 562 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 DOHHQ9BU89 302 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 PRDM14Q9GZV8 571 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 ADAM21Q9UKJ8 722 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 CAMK2AQ9UQM7 478 aa16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 SH3D21A4FU49 640 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 CD8B2A6NJW9 211 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 CLEC3AO75596 197 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 LRATO95237 230 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 IL18BPO95998 194 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 KRT14P02533 472 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 CCDC175P0C221 793 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 GNAZP19086 355 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 ABHD17CQ6PCB6 329 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 PRSS57Q6UWY2 283 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM139Q8IV31 216 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 ISL2Q96A47 359 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 TRIB1Q96RU8 372 aa16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 TRAPPC6AO75865 159 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 C1QAP02745 245 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 AHSGP02765 367 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 COX7A2P14406 83 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 PTMSP20962 102 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 CRYMQ14894 314 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 KRT78Q8N1N4 520 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 PIGTQ969N2 578 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF597Q96LX8 424 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 LYRM4Q9HD34 91 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 GUCA1BQ9UMX6 200 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 MED12Q93074 2177 aa16.59■□□□□ 0.25
UBE2C-208ENST00000617055 TRIM64A6NGJ6 449 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2C-208ENST00000617055 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2C-208ENST00000617055 TRIM64BA6NI03 449 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2C-208ENST00000617055 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
UBE2C-208ENST00000617055 ERN1O75460 977 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
UBE2C-208ENST00000617055 WDR47O94967 919 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2C-208ENST00000617055 IGKV3-11P04433 115 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2C-208ENST00000617055 FBXO45P0C2W1 286 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2C-208ENST00000617055 PGAM1P18669 254 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2C-208ENST00000617055 SERPINB3P29508 390 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2C-208ENST00000617055 MSH2P43246 934 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF75DP51815 510 aa16.58■□□□□ 0.24
UBE2C-208ENST00000617055 VASNQ6EMK4 673 aa16.58■□□□□ 0.24
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