RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 SP140LQ9H930 580 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 M0R129 80 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ZW10O43264 779 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 FGBP02675 491 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 OSMP13725 252 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CYP4F2P78329 520 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF45Q02386 682 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PRKCDQ05655 676 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ILKQ13418 452 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 DNASE1L3Q13609 305 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CADM3Q8N126 398 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MENTQ9BUN1 341 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 UCK2Q9BZX2 261 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 FZD3Q9NPG1 666 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MYO7AQ13402 2215 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 FAAHO00519 579 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MLC1Q15049 377 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PNCKQ6P2M8 343 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF607Q96SK3 696 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 HMGN4O00479 90 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 S100A5P33763 92 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 P2RY2P41231 377 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 VIPR2P41587 438 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 KCNJ5P48544 419 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 UGT2B15P54855 530 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SMIM11AP58511 58 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 INAVAQ3KP66 663 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 DCST1Q5T197 706 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 RGMAQ96B86 450 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 Q96MT0 163 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MGLLQ99685 303 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CENPOQ9BU64 300 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ABCG4Q9H172 646 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 LHX9Q9NQ69 397 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 DPP7Q9UHL4 492 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TLR4O00206 839 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SH3BP5O60239 455 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CDK3Q00526 305 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 HSPB3Q12988 150 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MAPK11Q15759 364 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 NUMA1Q14980 2115 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CCRL2O00421 344 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 NDUFS4O43181 175 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 B4GALT2O60909 372 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 HSMCR30P0CW71 290 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 OR5M11Q96RB7 305 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 A0A1W2PPV9 198 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 FAM227AF5H4B4 570 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 H7BY64 318 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TMPRSS11DO60235 418 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SEMA7AO75326 666 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 POU1F1P28069 291 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms