RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589759.1

ATP6V0A1-223, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 3

Gene ATP6V0A1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	POM121B	A6NF01	834 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759		A8MVJ9	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ARVCF	O00192	962 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CXCR6	O00574	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ACKR2	O00590	384 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FPGT	O14772	594 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	AZIN1	O14977	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MDM4	O15151	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NBN	O60934	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SCN2B	O60939	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ULK1	O75385	1050 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC22A3	O75751	556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UBXN7	O94888	489 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KDM4B	O94953	1096 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	STBD1	O95210	358 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SBF1	O95248	1867 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SERPINA3	P01011	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MB	P02144	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	STS	P08842	583 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SBK2	P0C263	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GAA	P10253	952 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC2A1	P11166	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	EDN3	P14138	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GABRA1	P14867	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GABRB1	P18505	474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CXCL3	P19876	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NPR2	P20594	1047 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GPD1	P21695	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UQCRC2	P22695	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CRABP1	P29762	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PRDX5	P30044	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CCR7	P32248	378 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ETV5	P41161	510 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CRYBB2	P43320	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GYG1	P46976	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GCGR	P47871	477 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HTR5A	P47898	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TBX4	P57082	545 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CD81	P60033	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RAB2A	P61019	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FOXO1	Q12778	655 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ITPK1	Q13572	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CDH18	Q13634	790 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KRT33B	Q14525	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	IRF4	Q15306	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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