RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 AVL9Q8NBF6 648 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 NUS1Q96E22 293 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 APOL2Q9BQE5 337 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TM2D2Q9BX73 214 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FAM153AQ9UHL3 310 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 OR1A2Q9Y585 309 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CPED1A4D0V7 1026 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 C5orf60A6NFR6 353 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FAM157AC9JC47 383 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 AGTP01019 485 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 IFNB1P01574 187 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CSF2P04141 144 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 HOXB5P09067 269 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 RABIFP47224 123 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 KCNJ1P48048 391 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 STC1P52823 247 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PDX1P52945 283 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 GEMP55040 296 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 INHBCP55103 352 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PFN3P60673 137 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 GNG11P61952 73 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 RUNX2Q13950 521 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FZD2Q14332 565 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SLC1A5Q15758 541 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00303Q3SY05 128 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 KCTD16Q68DU8 428 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TRIM74Q86UV6 250 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TRIM73Q86UV7 250 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 RBFAQ8N0V3 343 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 RASGEF1CQ8N431 466 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PRELID2Q8N945 189 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 POMGNT2Q8NAT1 580 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 OR4N2Q8NGD1 307 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 KAT2AQ92830 837 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 NAT6Q93015 286 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SGF29Q96ES7 293 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 DTD2Q96FN9 168 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 BBS4Q96RK4 519 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 AGAP2Q99490 1192 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 APOOQ9BUR5 198 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ABCG8Q9H221 673 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 OGFRQ9NZT2 677 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 C5AR2Q9P296 337 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SNX12Q9UMY4 172 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PSMD11O00231 422 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SEC14L5O43304 696 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 AQP9O43315 295 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PPFIA2O75334 1257 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFS3O75489 264 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ANXA9O76027 345 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SOD1P00441 154 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF20P17024 532 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF30P17039 623 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ADRA1AP35348 466 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LMAN1P49257 510 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CAMPP49913 170 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 THOP1P52888 689 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 RAD23AP54725 363 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PRPSAP1Q14558 356 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PTPRCAPQ14761 206 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ALS2CLQ60I27 953 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TTC27Q6P3X3 843 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CADM3Q8N126 398 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 RTP4Q96DX8 246 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms