RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 P4HA3Q7Z4N8 544 aa20.49■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 CMKLR1Q99788 373 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 SPARCP09486 303 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 MLIPQ5VWP3 458 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 TIGD4Q8IY51 512 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 HACD2Q6Y1H2 254 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 ENPP6Q6UWR7 440 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.47■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.47■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 NUP43Q8NFH3 380 aa20.47■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 CEACAM19Q7Z692 300 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 OR5T2Q8NGG2 359 aa20.46■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 FXYD6P3P58550 94 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 UBQLNLQ8IYU4 475 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 MAGIXQ9H6Y5 334 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 CLDND1Q9NY35 253 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 HYKKA2RU49 373 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 FUOMA2VDF0 154 aa20.46■□□□□ 0.87
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