RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM17Q86X19 198 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OR10G6Q8NH81 332 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TM9SF2Q99805 663 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SLC2A11Q9BYW1 496 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SIAEQ9HAT2 523 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NUP50Q9UKX7 468 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 E2F3O00716 465 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 COCHO43405 550 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SCN2BO60939 215 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OR7A10O76100 309 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PRSS56P0CW18 603 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NDUFS1P28331 727 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 HK3P52790 923 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 UGT8Q16880 541 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 KLHL24Q6TFL4 600 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZVU0 165 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TIGD4Q8IY51 512 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NUDT15Q9NV35 164 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MEMO1Q9Y316 297 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SLC22A31A6NKX4 558 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 GPR37L1O60883 481 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 RENP00797 406 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PCCBP05166 539 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 CD9P21926 228 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 GALNT10Q86SR1 603 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SERINC5Q86VE9 423 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PIANPQ8IYJ0 282 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 HUS1BQ8NHY5 278 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 WDR45Q9Y484 360 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PHLPP1O60346 1717 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ITPKBP27987 946 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 FBXO42Q6P3S6 717 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NAGSQ8N159 534 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 CHST4Q8NCG5 386 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SGCDQ92629 289 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 GGHQ92820 318 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 RFPL3O75679 317 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 BPIP17213 487 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PTPN2P17706 415 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 POU4F2Q12837 409 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 HACD4Q5VWC8 232 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 STEAP3Q658P3 488 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZVL8 140 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ATCAYQ86WG3 371 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF227Q86WZ6 799 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 THAP6Q8TBB0 222 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 GLYATL1Q969I3 302 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ACPTQ9BZG2 426 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 IFT46Q9NQC8 304 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0G2JN53 185 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PQ09 198 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PREPP48147 710 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 GPR68Q15743 365 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 FAM189A2Q15884 450 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 BCL7AQ4VC05 210 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 FRMPD2BQ6IN97 320 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms