RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CT55	Q8WUE5	264 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CRB3	Q9BUF7	120 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	WDR54	Q9H977	334 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	C5AR2	Q9P296	337 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	KCND3	Q9UK17	655 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	GABRR3	A8MPY1	467 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	C21orf140	B9A014	251 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD28	O15084	1053 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PGRMC2	O15173	223 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	DYRK3	O43781	588 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	OR10H2	O60403	315 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CTNS	O60931	367 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	JRK	O75564	520 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	IFNA16	P05015	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PGR	P06401	933 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CYC1	P08574	325 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	GPC1	P35052	558 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	STAT5A	P42229	794 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	EMP2	P54851	167 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	DNASE1L3	Q13609	305 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	LCN10	Q6JVE6	187 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	VPS50	Q96JG6	964 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	DGAT2	Q96PD7	388 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	OR52E6	Q96RD3	313 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ACTL8	Q9H568	366 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	C3orf18	Q9UK00	162 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PRB8	838 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	IDS	B3KWA1	339 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FGF17	O60258	216 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ANP32D	O95626	131 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	GPR75	O95800	540 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	IGHE	P01854	428 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ADRB1	P08588	477 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	LAMP1	P11279	417 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TNNI3	P19429	210 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MAOA	P21397	527 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	NT5E	P21589	574 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	IL12A	P29459	219 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PRDX6	P30041	224 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MPI	P34949	423 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	XK	P51811	444 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62	4e-6	■□□□□ 8.1
DDB1-223	ENST00000543658	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ID2	Q02363	134 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	STX5	Q13190	355 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	RCAN2	Q14206	197 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TERF2	Q15554	542 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	NSDHL	Q15738	373 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		11.17	□□□□□ -0.62

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