RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATP1B1P05026 303 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF735P0CB33 412 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPIAL4GP0DN37 164 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC2A3P11169 496 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ITGA2P17301 1181 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 AMD1P17707 334 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 MSH3P20585 1137 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 PROZP22891 400 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR1D2P34982 312 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 RFC4P35249 363 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 NPY2RP49146 381 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 RGS4P49798 205 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 LIMK2P53671 638 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 RPL24P83731 157 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 RELQ04864 619 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 SRYQ05066 204 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 FGL1Q08830 312 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLD1Q13393 1074 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 NFATC2Q13469 925 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 HERC3Q15034 1050 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 GPR33Q49SQ1 333 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 Q4G0T1 1027 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 CAVIN4Q5BKX8 364 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 RABGAP1LQ5R372 815 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARMC12Q5T9G4 340 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRAMEF20Q5VT98 475 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 LIPKQ5VXJ0 399 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 LIPJQ5W064 366 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 TTC23Q5W5X9 447 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ASPHD2Q6ICH7 369 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC39A4Q6P5W5 647 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 RAD9BQ6WBX8 426 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 GCNT7Q6ZNI0 430 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ERASQ7Z444 233 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ODF3L1Q8IXM7 274 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 MARVELD2Q8N4S9 558 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 TEX26Q8N6G2 289 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLHDC1Q8N7A1 406 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 CEP112Q8N8E3 955 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 NIPA2Q8N8Q9 360 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRR26Q8N8Z3 221 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRTM2Q8N967 370 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF114Q8NC26 417 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 C8orf46Q8TAG6 207 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC2A14Q8TDB8 520 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 DPF1Q92782 380 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 NT5C3BQ969T7 300 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 PNPLA2Q96AD5 504 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 NXPE2Q96DL1 559 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 AKR1E2Q96JD6 320 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 C4orf36Q96KX1 117 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 DEFB118Q96PH6 123 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 FCRL4Q96PJ5 515 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 LPAR4Q99677 370 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 DCTN5Q9BTE1 182 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM192AQ9GZU8 254 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 WWP1Q9H0M0 922 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 EBF3Q9H4W6 596 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 EXO5Q9H790 373 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF665Q9H7R5 613 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 YY1AP1Q9H869 796 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 FANCEQ9HB96 536 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 GDF3Q9NR23 364 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR6C2Q9NZP2 312 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 HACD3Q9P035 362 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 WNT16Q9UBV4 365 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 RPH3ALQ9UNE2 315 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 B9D1Q9UPM9 204 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR1A2Q9Y585 309 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADAMTS20P59510 1910 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF804BA4D1E1 1349 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 A0A1W2PS18 150 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 RNF222A6NCQ9 220 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 ASPDHA6ND91 283 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 C5orf60A6NFR6 353 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 SERINC4A6NH21 518 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 NPIPA2E9PIF3 369 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-928P-201ENST00000516876 STX7O15400 261 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms