RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516663.1

RNU6-521P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 521, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-521P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-521P-201ENST00000516663 RETP07949 1114 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 LINGO3P0C6S8 592 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 SP9P0CG40 484 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 LAMP2P13473 410 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 EEF2P13639 858 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 ACP1P24666 158 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 CCNCP24863 283 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 UGT1A3P35503 534 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 RPS9P46781 194 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 TFPI2P48307 235 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 MFAP2P55001 183 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 MAPK11Q15759 364 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 ABCA11PQ4W5N1 156 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 EOGTQ5NDL2 527 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 GALNT17Q6IS24 598 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 SLC27A4Q6P1M0 643 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 LAX1Q8IWV1 398 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 TTC5Q8N0Z6 440 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 C6orf223Q8N319 242 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 Q8N9W7 124 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 CAMKVQ8NCB2 501 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 C8orf46Q8TAG6 207 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 CD99L2Q8TCZ2 262 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 CPNE1Q99829 537 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 UBA5Q9GZZ9 404 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 Q9H3A6 140 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 GORASP2Q9H8Y8 452 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 MRGBPQ9NV56 204 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 IRAK4Q9NWZ3 460 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 ERVW-1Q9UQF0 538 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 TRAV40A0A0B4J280 105 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 A6NLC8 198 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 OR7A17O14581 309 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 RIPK2O43353 540 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 SLC2A10O95528 541 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 GOT2P00505 430 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 FHP07954 510 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 MYL6BP14649 208 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 COL8A2P25067 703 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 CALML3P27482 149 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 HOXD10P28358 340 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 ARL3P36405 182 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 HSD17B3P37058 310 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 CTRLP40313 264 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 ID1P41134 155 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 OR3A3P47888 321 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 NRIP1P48552 1158 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 CCT5P48643 541 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 CSNK1DP48730 415 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 LIG4P49917 911 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 ARHGDIBP52566 201 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 SULT2A1Q06520 285 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 UNC119Q13432 240 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 MAMLD1Q13495 774 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 EMC2Q15006 297 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 PPA1Q15181 289 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 SNAPC1Q16533 368 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 PTGISQ16647 500 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 TSTQ16762 297 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 SPIN3Q5JUX0 258 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 PLPP4Q5VZY2 271 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 FAM219BQ5XKK7 198 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 SULT1C3Q6IMI6 304 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 PIGWQ7Z7B1 504 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 NAA40Q86UY6 237 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF429Q86V71 674 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 OR10H4Q8NGA5 316 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 SMPDL3AQ92484 453 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 USP6NLQ92738 828 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 RDH5Q92781 318 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 SMARCD2Q92925 531 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 PYCR2Q96C36 320 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 TSNARE1Q96NA8 513 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 PAFAH2Q99487 392 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 ELOVL4Q9GZR5 314 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 IL1RL2Q9HB29 575 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 APMAPQ9HDC9 416 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms