RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516530.1

RNU6-1061P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1061, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1061P, Length 99 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TTC27Q6P3X3 843 aa-0.04□□□□□ -2.42
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RNU6-1061P-201ENST00000516530 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 NEGR1Q7Z3B1 354 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GPR141Q7Z602 305 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 FBXW8Q8N3Y1 598 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CCDC63Q8NA47 563 aa-0.06□□□□□ -2.42
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