RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	RAB12	Q6IQ22	244 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNMB4	Q86W47	210 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PHC2	Q8IXK0	858 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF597	Q96LX8	424 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ATF6B	Q99941	703 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PINK1	Q9BXM7	581 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ABCG8	Q9H221	673 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CHD1	O14646	1710 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TLR4	O00206	839 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PDHX	O00330	501 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC28A1	O00337	649 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF749	O43361	778 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CPNE6	O95741	557 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CD1D	P15813	335 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF18	P17022	549 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	DSCR10	P59022	87 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SRPX	P78539	464 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CARM1	Q86X55	608 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CACUL1	Q86Y37	369 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	OR2L2	Q8NH16	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	URGCP	Q8TCY9	931 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	DTD2	Q96FN9	168 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	RUFY1	Q96T51	708 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SSX3	Q99909	188 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	AGPAT1	Q99943	283 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR41	Q9HAD4	459 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	GNB4	Q9HAV0	340 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	IL19	Q9UHD0	177 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC69	A6NI79	296 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SFTPB	P07988	381 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TPBGL	P0DKB5	382 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP3A5	P20815	502 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	GPX3	P22352	226 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PGF	P49763	221 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP4B	P51164	291 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	GEM	P55040	296 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CASP9	P55211	416 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	HERV-K104	P63124	156 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	RBBP4	Q09028	425 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	WASHC5	Q12768	1159 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	COX10	Q12887	443 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TRADD	Q15628	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	MCM10	Q7L590	875 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CCNY	Q8ND76	341 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	OR4L1	Q8NH43	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	LIPH	Q8WWY8	451 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PCED1B	Q96HM7	432 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	S1PR3	Q99500	378 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	OCR1	Q9BZK8	76 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	STRADB	Q9C0K7	418 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM245	Q9H330	911 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	JPT2	Q9H910	190 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		3.56	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms