RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 NMUR2Q9GZQ4 415 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 GIMAP4Q9NUV9 329 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 FBXW2Q9UKT8 454 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 PADI1Q9ULC6 663 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ATG4BQ9Y4P1 393 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 COL12A1Q99715 3063 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PR48 441 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 BBIP1A8MTZ0 92 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CDRT15L2A8MXV6 281 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 C9orf172C9J069 976 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 STMND1H3BQB6 276 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CYR61O00622 381 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CFLARO15519 480 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CTNSO60931 367 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SLITRK5O94991 958 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 AIFM1O95831 613 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 GBAP04062 536 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NTRK1P04629 796 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 FHP07954 510 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 IFI6P09912 130 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 FURINP09958 794 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 RAB40ALP0C0E4 278 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ITGAXP20702 1163 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MNAT1P51948 309 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 KCNK10P57789 538 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 KLF10Q13118 480 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 STX5Q13190 355 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SERTAD2Q14140 314 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 RCAN2Q14206 197 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PTGR1Q14914 329 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 KRT72Q14CN4 511 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 COQ5Q5HYK3 327 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CPTPQ5TA50 214 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 FAM219BQ5XKK7 198 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SLC38A9Q8NBW4 561 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NACC2Q96BF6 587 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PPCDCQ96CD2 204 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 EGLN2Q96KS0 407 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CCDC106Q9BWC9 280 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ACTL8Q9H568 366 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 RMND5AQ9H871 391 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 THSD1Q9NS62 852 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 WDR70Q9NW82 654 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TRPC4Q9UBN4 977 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 VSTM2BA6NLU5 285 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 GABRR3A8MPY1 467 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 C21orf140B9A014 251 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 BMP10O95393 424 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NPPAP01160 153 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 IGHEP01854 428 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 COX7A2P14406 83 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 S100A3P33764 101 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 GALNSP34059 522 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MPIP34949 423 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 KIR3DL1P43629 444 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 XCR1P46094 333 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 OR1D4P47884 311 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 UFM1P61960 85 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MLC1Q15049 377 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CEBPEQ15744 281 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 AGKQ53H12 422 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 C1orf189Q5VU69 101 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NLGN4XQ8N0W4 816 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 OR4K14Q8NGD5 310 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ZFP28Q8NHY6 868 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CDC26Q8NHZ8 85 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 DNAJB14Q8TBM8 379 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MIEF2Q96C03 454 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 EFHD1Q9BUP0 239 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 GPR87Q9BY21 358 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 DPH1Q9BZG8 443 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TRIM4Q9C037 500 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ASCL3Q9NQ33 180 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CCDC167Q9P0B6 97 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CES1P1Q9UKY3 287 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms