RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRAME-212ENST00000485532 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 NCKAP5O14513 1909 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 NKX2-6A6NCS4 301 aa11.71□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 SAP18O00422 153 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 TM9SF1O15321 606 aa11.71□□□□□ -0.53
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