RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 SERTM1A2A2V5 107 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 UROSP10746 265 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 CASRP41180 1078 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 MAPK12P53778 367 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 H3F3CQ6NXT2 135 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 Q8NA96 180 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TANKQ92844 425 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 LMF1Q96S06 567 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PLA2G3Q9NZ20 509 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 VTI1BQ9UEU0 232 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 WDR91A4D1P6 747 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PGRMC2O15173 223 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 MAN1A2O60476 641 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 F10P00742 488 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 DHRS4L1P0CG22 281 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 ST13P50502 369 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 RAE1P78406 368 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 BTKQ06187 659 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 SERTAD2Q14140 314 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TERF2Q15554 542 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 CES4AQ5XG92 561 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 CRLF3Q8IUI8 442 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 MMP21Q8N119 569 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 APCDD1LQ8NCL9 501 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 B3GNT7Q8NFL0 401 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM233B4DJY2 109 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 AZIN1O14977 448 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 OR6Y1Q8NGX8 325 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TRIM4Q9C037 500 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 WDR41Q9HAD4 459 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A1W2PS29 197 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PLA2G2AP14555 144 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR143P51810 404 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC18A1P54219 525 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 IMPG1Q17R60 797 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 ABHD17BQ5VST6 288 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 Q6ZS92 163 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 NUDCD3Q8IVD9 361 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 CATSPER1Q8NEC5 780 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 DNAJB14Q8TBM8 379 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 NCLNQ969V3 563 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PNPLA2Q96AD5 504 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TM4SF18Q96CE8 201 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PCDH7O60245 1069 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 WDR4P57081 412 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 ACSM2AQ08AH3 577 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 SPIN4Q56A73 249 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 SPDYAQ5MJ70 313 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 ACER2Q5QJU3 275 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 KANK2Q63ZY3 851 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 ACSM2BQ68CK6 577 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 OR52E8Q6IFG1 317 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TRIM46Q7Z4K8 759 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF321PQ8N8H1 164 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 AGR3Q8TD06 166 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 MGARPQ8TDB4 240 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 DOK4Q8TEW6 326 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 DGAT2Q96PD7 388 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 EBPLQ9BY08 206 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 MCM8Q9UJA3 840 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 CROCCQ5TZA2 2017 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 C17orf105B2RV13 164 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR75O95800 540 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 WDPCPO95876 746 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TNNI3P19429 210 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 STT3AP46977 705 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 MLLT10P55197 1068 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TAS2R50P59544 299 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TLE1Q04724 770 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 BEST3Q8N1M1 668 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 OR14A16Q8NHC5 309 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 VMP1Q96GC9 406 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF354BQ96LW1 612 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TUBB1Q9H4B7 451 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 CDCP1Q9H5V8 836 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 STMN3Q9NZ72 180 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 TEKT2Q9UIF3 430 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 CCL27Q9Y4X3 112 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF3C4-202ENST00000483873 DDAH2O95865 285 aa24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms