RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL6Q8WZ60 621 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 KCTD7Q96MP8 289 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 NIPAL2Q9H841 368 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CTPS2Q9NRF8 586 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL21Q9UJP4 597 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 POM121CA8CG34 1229 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 SSNA1O43805 119 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TRBC1P01850 177 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ADRA2AP08913 450 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 LAMP1P11279 417 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 EPHB3P54753 998 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CLDN8P56748 225 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 DUOXA1Q1HG43 343 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CBLL1Q75N03 491 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF366Q8N895 744 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 GDPD1Q8N9F7 314 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 OR52P1PQ8NH57 321 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 UPRTQ96BW1 309 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 PITX2Q99697 317 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TMED9Q9BVK6 235 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 STUB1Q9UNE7 303 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TRAPPC4Q9Y296 219 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 HOXA2O43364 376 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 PCDH7O60245 1069 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 URODP06132 367 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 OR2G6Q5TZ20 316 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 RETSATQ6NUM9 610 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 FAHD1Q6P587 224 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TCTE3Q8IZS6 198 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 GPR26Q8NDV2 337 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 OR4K1Q8NGD4 311 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 GATAD2BQ8WXI9 593 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 NELL2Q99435 816 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TLR4O00206 839 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TAPBPO15533 448 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ETFAP13804 333 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 NNMTP40261 264 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 COX10Q12887 443 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 LMAN2Q12907 356 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ANGPT1Q15389 498 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM150AQ86TG1 271 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ATCAYQ86WG3 371 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CALHM3Q86XJ0 350 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf65Q8NCR3 313 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 RNF208Q9H0X6 261 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 MTG2Q9H4K7 406 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ACSL6Q9UKU0 697 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 SHOXO15266 292 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CSO75390 466 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CTRB1P17538 263 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ACSM2AQ08AH3 577 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 DOC2BQ14184 412 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ACSM2BQ68CK6 577 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CTRB2Q6GPI1 263 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 USP45Q70EL2 814 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 RBFAQ8N0V3 343 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB2Q8N680 514 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 VPS37AQ8NEZ2 397 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 OR4M2Q8NGB6 313 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 DOHHQ9BU89 302 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 SCML1Q9UN30 329 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 MGAT4DA6NG13 374 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 PLATP00750 562 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ALPPP05187 535 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB103AP81534 67 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TLE2Q04725 743 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 RGS1Q08116 209 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 IFI44LQ53G44 452 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CHST9Q7L1S5 443 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 FAM124AQ86V42 546 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 FOXJ1Q92949 421 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 MIXL1Q9H2W2 232 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 C12orf10Q9HB07 376 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms