RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRIN2CQ14957 1233 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.131e-6■■■□□ 15.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARMC10Q8N2F6 343 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF175Q8N4F7 328 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC5A8Q8N695 610 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF527Q8NB42 609 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AASSQ9UDR5 926 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LOC100509620A0A075B734 347 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCP4L1A6NKN8 68 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BMP2P12643 396 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NRG3P56975 720 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAMK1Q14012 370 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMCO1Q147U7 214 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM214AQ32MH5 1076 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FIGNL1Q6PIW4 674 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR83Q9NYM4 423 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSD3B1P14060 373 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL1RNP18510 177 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSD3B2P26439 372 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC6A9P48067 706 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VEGFBP49765 207 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DECR1Q16698 335 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IQCF2Q8IXL9 164 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM217AQ8IXS0 508 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFAND2BQ8WV99 257 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRR1Q96L50 414 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TACSTD2P09758 323 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCTP40126 519 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GCGRP47871 477 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMBIM6P55061 237 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARFRP1Q13795 201 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM19Q96HH6 336 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COQ9O75208 318 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGA10O75578 1167 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARL6IP5O75915 188 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHAF1BQ13112 559 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C4orf46Q504U0 113 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR5AR1Q8NGP9 310 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFT46Q9NQC8 304 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPCAMP16422 314 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNC1P48547 511 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEFB103AP81534 67 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB41Q5JT25 222 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAXEQ8NCW5 288 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMARCD2Q92925 531 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RETREG1Q9H6L5 497 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BMXP51813 675 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRISP1P54107 249 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC36A4Q6YBV0 504 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OSTF1Q92882 214 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTCHD1Q96NR3 888 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENTPD6O75354 484 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLCA4Q14CN2 919 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPHARQ15513 63 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAZQ16635 292 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NRROSQ86YC3 692 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC30A3Q99726 388 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AREL1O15033 823 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VEGFDO43915 354 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOX30O94993 753 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DSG2Q14126 1118 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COQ5Q5HYK3 327 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHF19Q5T6S3 580 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM151AQ8N4L1 468 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATOH8Q96SQ7 321 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MACROD1Q9BQ69 325 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EHD1Q9H4M9 534 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEC14L4Q9UDX3 406 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDCD5O14737 125 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MUSKO15146 869 aa15.85■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB36O95755 333 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms