RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TLR1Q15399 786 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 MEP1AQ16819 746 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 KRT71Q3SY84 523 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ACER2Q5QJU3 275 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 COMMD6Q7Z4G1 85 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 LGI4Q8N135 537 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ARMC10Q8N2F6 343 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SLC5A8Q8N695 610 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 DNAJB14Q8TBM8 379 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 NCLNQ969V3 563 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 VMP1Q96GC9 406 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ZNF354BQ96LW1 612 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 FAM111AQ96PZ2 611 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SLC17A7Q9P2U7 560 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 MID2Q9UJV3 735 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ADAM29Q9UKF5 820 aa13.14□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CACNA1DQ01668 2161 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 OR5H15A6NDH6 313 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SPAG7O75391 227 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TUBBP07437 444 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CHN1P15882 459 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ST13P50502 369 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SERTAD2Q14140 314 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 C10orf107Q8IVU9 208 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 OR4N5Q8IXE1 308 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 OR14A16Q8NHC5 309 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 METTL6Q8TCB7 284 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TCP10LQ8TDR4 215 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 UCN3Q969E3 161 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 C19orf60Q96EN9 201 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ACPTQ9BZG2 426 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ASF1BQ9NVP2 202 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 STMN3Q9NZ72 180 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 AHSPQ9NZD4 102 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TIMM22Q9Y584 194 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CENPEQ02224 2701 aa13.13□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TRAV17A0A0B4J275 112 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 GLOD5A6NK44 160 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 WASHC1A8K0Z3 465 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 GABRR3A8MPY1 467 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 C17orf105B2RV13 164 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 DDAH2O95865 285 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 IFNA16P05015 189 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 KLK1P06870 262 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 STT3AP46977 705 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 UQCRFS1P47985 274 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CLCN2P51788 898 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TUBA3CQ13748 450 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 OR52E8Q6IFG1 317 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TUBA3EQ6PEY2 450 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 PAGE2Q7Z2X7 111 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ZNF321PQ8N8H1 164 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 MDS2Q8NDY4 140 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SLC2A12Q8TD20 617 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TANKQ92844 425 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ZIM3Q96PE6 472 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 SMC6Q96SB8 1091 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 MECRQ9BV79 373 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CDCP1Q9H5V8 836 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 VPS29Q9UBQ0 182 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa13.12□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 A0A1W2PS29 197 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 H3BQF6 201 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TYROBPO43914 113 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TRIM13O60858 407 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ULK1O75385 1050 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ALDH3A1P30838 453 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 MAPK12P53778 367 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 MLF1P58340 268 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 RAE1P78406 368 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 PLIN5Q00G26 463 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 HMGCS1Q01581 520 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CFAP157Q5JU67 520 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 MORN4Q8NDC4 146 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 OR1N1Q8NGS0 311 aa13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SRRT-210ENST00000477529 DEFB126Q9BYW3 111 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms