RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 ADAM8P78325 824 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 LTBQ06643 244 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CYP1B1Q16678 543 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SLC22A10Q63ZE4 541 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 NAXEQ8NCW5 288 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DOK4Q8TEW6 326 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF721Q8TF20 911 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 FAM222BQ8WU58 562 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 VPS39Q96JC1 886 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF597Q96LX8 424 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DOHHQ9BU89 302 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 LYRM4Q9HD34 91 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DLL4Q9NR61 685 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CAMK2AQ9UQM7 478 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PSAT1Q9Y617 370 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TUBAL3A6NHL2 446 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 FGF17O60258 216 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TRAPPC6AO75865 159 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ATE1O95260 518 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 IL2RAP01589 272 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 FOSL1P15407 271 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TAS2R39P59534 338 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PLIN5Q00G26 463 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 POU4F3Q15319 338 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TOMM20Q15388 145 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PDK4Q16654 411 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 MPEG1Q2M385 716 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 HYAL4Q2M3T9 481 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PIGGQ5H8A4 983 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF793Q6ZN11 406 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SLC29A4Q7RTT9 530 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 BIVMQ86UB2 503 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PDIK1LQ8N165 341 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TCAIMQ8N3R3 496 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SPATA6LQ8N4H0 392 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 OR10G3Q8NGC4 313 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 NEIL3Q8TAT5 605 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 NUBPLQ8TB37 319 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ESAMQ96AP7 390 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 HSPBAP1Q96EW2 488 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ART5Q96L15 291 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SMR3AQ99954 134 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SH3GL2Q99962 352 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 NT5DC2Q9H857 520 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CD274Q9NZQ7 290 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ARID1AO14497 2285 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GTL3 188 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 HRKO00198 91 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SYT5O00445 386 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 OR10H2O60403 315 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SERPINB3P29508 390 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 STT3AP46977 705 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 MASP1P48740 699 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RAP1GDS1P52306 607 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 HERVK_113P63132 956 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ERVK-8P63133 956 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms