RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-210ENST00000449058 RAB7BQ96AH8 199 aa16.08■□□□□ 0.17
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TOM1-210ENST00000449058 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TOM1-210ENST00000449058 MLC1Q15049 377 aa16.06■□□□□ 0.16
TOM1-210ENST00000449058 WSCD2Q2TBF2 565 aa16.06■□□□□ 0.16
TOM1-210ENST00000449058 SPDYE7PQ495Y7 208 aa16.06■□□□□ 0.16
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