RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 CD97P48960 835 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CLCN2P51788 898 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC18A1P54219 525 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 HMGCS1Q01581 520 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 FOLH1Q04609 750 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ACSM2AQ08AH3 577 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MEP1AQ16819 746 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ACER2Q5QJU3 275 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM219BQ5XKK7 198 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ACSM2BQ68CK6 577 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 OR52E8Q6IFG1 317 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CLYBLQ8N0X4 340 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 APCDD1LQ8NCL9 501 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 VMP1Q96GC9 406 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 APIPQ96GX9 242 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNK9Q9NPC2 374 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CCL27Q9Y4X3 112 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 BSNQ9UPA5 3926 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf226A1L170 272 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC28A1O00337 649 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PGRMC2O15173 223 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC28A2O43868 658 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CHRNGP07510 517 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC35E2P0CK97 266 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 COX7A2P14406 83 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PRPH2P23942 346 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GSTM5P46439 218 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MPP2Q14168 576 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TLR1Q15399 786 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 KANK2Q63ZY3 851 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SCIMPQ6UWF3 145 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4N5Q8IXE1 308 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM76AQ8TAV0 307 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 DGAT2Q96PD7 388 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 FAIM2Q9BWQ8 316 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MFRPQ9BY79 579 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAF6Q9Y4K3 522 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 KALRNO60229 2985 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GLOD5A6NK44 160 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 WASHC1A8K0Z3 465 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 C17orf105B2RV13 164 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDH7O60245 1069 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFAND5O76080 213 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CHEK2O96017 543 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 UQCRHP07919 91 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 DRD2P14416 443 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 RAE1P78406 368 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ARG2P78540 354 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PLIN5Q00G26 463 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ID2Q02363 134 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 IMPG1Q17R60 797 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT3A2Q3SY77 523 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SPDYAQ5MJ70 313 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC6AQ6EIG7 209 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CRLF3Q8IUI8 442 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF2BQ8N4N8 673 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 Q8NA96 180 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4K14Q8NGD5 310 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1N1Q8NGS0 311 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 OR8K3Q8NH51 312 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 UCN3Q969E3 161 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TLCD1Q96CP7 247 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 NPAS2Q99743 824 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB126Q9BYW3 111 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 EPN3Q9H201 632 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ABI3Q9P2A4 366 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CES1P1Q9UKY3 287 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PSME2Q9UL46 239 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 RGS14O43566 566 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 DYRK3O43781 588 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 DDAH2O95865 285 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 WDPCPO95876 746 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINE1P05121 402 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PLA2G2AP14555 144 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GRK2P25098 689 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PIK3R1P27986 724 aa15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.7 ms