RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CALML6Q8TD86 181 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 SLC44A1Q8WWI5 657 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 TANKQ92844 425 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ISOC1Q96CN7 298 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 GIMAP5Q96F15 307 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 C1orf21Q9H246 121 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 VPS11Q9H270 941 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 SERHL2Q9H4I8 314 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRR-204ENST00000440835 SEC16AO15027 2179 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC88CQ9P219 2028 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 FAM159BA6NKW6 160 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ATE1O95260 518 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRR-204ENST00000440835 MAGP20916 626 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRR-204ENST00000440835 GRIA3P42263 894 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CA7P43166 264 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRR-204ENST00000440835 GRB7Q14451 532 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 GBX1Q14549 363 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRR-204ENST00000440835 FAM182AQ5T1J6 154 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRR-204ENST00000440835 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF534Q76KX8 674 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CADM3Q8N126 398 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 STT3BQ8TCJ2 826 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 SMPDL3AQ92484 453 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 C14orf79Q96F83 325 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF354BQ96LW1 612 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 TSNARE1Q96NA8 513 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CPNE1Q99829 537 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 APOL2Q9BQE5 337 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PARVBQ9HBI1 364 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PRM3Q9NNZ6 103 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CATSPERZQ9NTU4 200 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 GID8Q9NWU2 228 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRR-204ENST00000440835 PRR35P0CG20 571 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 COX6A1P12074 109 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 EPB42P16452 691 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 NR4A1P22736 598 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CCR7P32248 378 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 SPRP35270 261 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 SLC26A3P40879 764 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 AGTR2P50052 363 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 BMXP51813 675 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 EMP2P54851 167 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CDH15P55291 814 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 B2MP61769 119 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 SKP1P63208 163 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRR-204ENST00000440835 EXT1Q16394 746 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 GRTP1Q5TC63 336 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRR-204ENST00000440835 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRR-204ENST00000440835 OR2L3Q8NG85 312 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 OR13J1Q8NGT2 312 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 MZB1Q8WU39 189 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 HPS1Q92902 700 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 TAMM41Q96BW9 452 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CERS2Q96G23 380 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 TUBA1CQ9BQE3 449 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PCBD2Q9H0N5 130 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 Q9H521 79 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 C3orf18Q9UK00 162 aa5.68□□□□□ -1.5
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