RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 H3BUI4 141 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 RIN1Q13671 783 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 AANATQ16613 207 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 PTPRNQ16849 979 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 HKDC1Q2TB90 917 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ERICH5Q6P6B1 374 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 DOK6Q6PKX4 331 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ARSKQ6UWY0 536 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CBLL1Q75N03 491 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 INPP5KQ9BT40 448 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SEC14L4Q9UDX3 406 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 TOR1AO14656 332 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 INSIG1O15503 277 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 TSPAN12O95859 305 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 LGI1O95970 557 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ADRA2AP08913 450 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 PTPN6P29350 595 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 TGM4P49221 684 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ETV1P50549 477 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CLDN20P56880 219 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 RHOAP61586 193 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 B2MP61769 119 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 IQCCQ4KMZ1 466 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 COMMD7Q86VX2 200 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 FEVQ99581 238 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SLC28A1O00337 649 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SLC43A1O75387 559 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 OTCP00480 354 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 PRSS56P0CW18 603 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ARSBP15848 533 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ITGB7P26010 798 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 EVI2BP34910 448 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 HMGCLP35914 325 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CRYBB2P43320 205 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 DOC2BQ14184 412 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 STK11Q15831 433 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 VMACQ2NL98 169 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 WSCD2Q2TBF2 565 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 NCEH1Q6PIU2 408 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 GALNT10Q86SR1 603 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 GLCCI1Q86VQ1 547 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM69Q86WT6 500 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 TESCQ96BS2 214 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ASIC5Q9NY37 505 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 DEC1Q9P2X7 70 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ANTXRLA6NF34 631 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 NDUFA2O43678 99 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ORC5O43913 435 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 HCN1O60741 890 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 IFNA16P05015 189 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 S100A3P33764 101 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 GTF2H2Q13888 395 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 PLAG1Q6DJT9 500 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 FAM124AQ86V42 546 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 C19orf18Q8NEA5 215 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SLC25A46Q96AG3 418 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 TRIB3Q96RU7 358 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 MARVELD1Q9BSK0 173 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SLC25A13Q9UJS0 675 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 HLA-DQB1P01920 261 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 FAM157BP0CG42 384 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 IL2P60568 153 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 RHAGQ02094 409 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 SLC14A1Q13336 389 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 LEXMQ3ZCV2 418 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 HSDL2Q6YN16 418 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 C16orf62Q7Z3J2 963 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-205ENST00000436404 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms